结论：社区医院将抓出的草药制成水丸是否合法，需根据具体情况判断，包括是否具备相应资质、是否符合药品生产规范以及是否获得患者同意等。以下从多个角度进行详细分析：

1. 资质与许可角度：

   • 合法性前提：社区医院若要将草药制成水丸，首先需确保自身具备相应的药品生产或加工资质。这通常涉及到《药品管理法》及相关实施条例中关于药品生产、加工、销售等环节的资质要求。
   • 资质要求：根据《药品管理法》，生产药品需取得药品生产许可证，并符合药品生产质量管理规范（GMP）。若社区医院未取得相应资质，擅自进行药品加工，则可能构成违法行为。

2. 药品生产规范角度：

   • 生产流程合规性：即使社区医院具备相应资质，也需确保水丸的生产流程符合药品生产规范。这包括原料的采购、储存、加工、包装、标签、说明书等各个环节，均需符合相关法规要求。
   • 质量控制：社区医院需建立严格的质量控制体系，确保水丸的质量稳定、安全有效。若因生产流程不规范或质量控制不严导致药品质量问题，可能引发医疗纠纷或法律责任。

3. 患者同意与知情权角度：

   • 患者同意：社区医院在将草药制成水丸前，应获得患者的明确同意。患者有权了解药品的来源、成分、制作工艺及可能的风险等信息，并在此基础上做出知情选择。
   • 知情权保障：社区医院需向患者充分披露相关信息，确保患者的知情权得到保障。若因未充分告知或隐瞒信息导致患者权益受损，社区医院可能承担相应的法律责任。

4. 特殊情况与例外：

   • 传统医学与民间疗法：在某些地区或特定情况下，传统医学或民间疗法可能享有特殊的法律地位或豁免。然而，这并不意味着可以随意违反药品生产规范或忽视患者权益。社区医院在采用此类疗法时，仍需谨慎评估法律风险，并确保符合相关法规要求。
   • 紧急情况与特殊需求：在紧急情况下或满足特定患者需求时，社区医院可能需要在不具备完整资质的情况下进行药品加工。然而，这种情况应受到严格限制，并需在事后及时补办相关手续或接受监管部门的审查。

建议与后续行动：

• 核实资质：社区医院应首先核实自身是否具备药品生产或加工资质，并了解相关法规要求。
• 完善流程：若具备资质，社区医院应完善水丸的生产流程，确保符合药品生产规范和质量控制要求。
• 充分告知：在将草药制成水丸前，社区医院应向患者充分披露相关信息，并获得患者的明确同意。
• 咨询监管：如有疑问或不确定之处，社区医院可咨询当地药品监管部门或法律专业人士，以确保合法合规。

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