支付保函可以约定双方的履约义务，但需注意其法律性质和具体条款的设定。以下从不同角度为你详细分析：
一、支付保函的基本法律性质
支付保函，通常作为担保合同的一种，其核心功能在于为受益人（如买方或债权人）提供一种经济上的保障，确保在申请人（如卖方或债务人）不履行其义务时，受益人能够从担保人（通常是银行或保险公司）处获得相应的赔偿。这种担保关系是基于合同法的原则建立的，因此，支付保函的内容，包括双方的权利义务，应当遵循合同法的相关规定。
二、支付保函中约定履约义务的合法性
合同自由原则：根据合同法的相关规定，合同双方有权在平等、自愿的基础上，就合同的内容进行协商和约定。因此，在支付保函中约定双方的履约义务，是合同自由原则的体现，具有合法性。
担保合同的从属性：虽然支付保函作为担保合同，具有从属性，即其存在和效力依赖于主合同（如买卖合同、借款合同等）的存在和效力。但这并不妨碍在支付保函中就担保范围内的具体事项，包括双方的履约义务，进行详细约定。
三、支付保函中约定履约义务的具体内容
申请人的履约义务：在支付保函中，可以明确约定申请人在主合同项下的具体履约义务，如按时交货、提供符合质量标准的产品或服务等。这些义务应当与主合同中的约定相一致，以确保担保的针对性和有效性。
受益人的履约义务：虽然支付保函主要是为受益人提供担保，但在某些情况下，也可以在保函中约定受益人的某些履约义务，如按时支付货款、提供必要的协助等。这些约定有助于平衡双方的权利义务，促进合同的顺利履行。
担保人的责任范围：在支付保函中，还需要明确担保人的责任范围，即担保人承担赔偿责任的限额和条件。这通常与申请人的履约义务和受益人的索赔请求密切相关。
四、注意事项
条款的明确性：在支付保函中约定双方的履约义务时，应当确保条款的明确性和具体性，避免出现模糊或歧义的表述。这有助于减少争议和纠纷的发生。
合法性的审查：在约定履约义务时，应当确保这些约定不违反法律法规的强制性规定，不损害国家、社会公共利益或第三人的合法权益。
风险防控：对于双方来说，都应当在签订支付保函前对对方的履约能力进行充分的评估和了解，以降低合同履行过程中的风险。
总结来说，支付保函中可以约定双方的履约义务，但应当确保这些约定符合合同法的相关规定，具有明确性、具体性和合法性。如果你在签订或履行支付保函过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。