实际施工人与挂靠公司合同结束后，后期债务的处理需根据债务性质、合同约定及法律规定综合判断，具体分以下情况处理：

1. 合同明确约定债务承担主体的
   若实际施工人与挂靠公司在合同中明确约定了合同终止后债务的承担主体（如约定由实际施工人承担后续债务，或由挂靠公司承担连带责任），则优先按合同约定处理。但需注意，若合同约定违反法律强制性规定（如逃避债务、损害第三方利益），则该条款可能被认定无效。

2. 债务属于挂靠期间产生的工程相关债务

   • 对第三方（如材料供应商、分包商）的债务：根据《民法典》及相关司法解释，若债务因工程实际施工产生，且第三方善意（不知挂靠关系），挂靠公司作为名义承包人可能需先承担责任，后再向实际施工人追偿；若第三方明知挂靠关系，可能直接要求实际施工人与挂靠公司承担连带责任。
     
   • 对发包方的债务：如工程款结算、质量保修等，发包方通常有权要求挂靠公司（名义承包人）履行义务，挂靠公司承担后可根据内部协议向实际施工人追偿。
     

3. 债务属于实际施工人个人债务（与工程无关）
   若债务系实际施工人个人行为产生（如借款、私人交易），与挂靠工程无关，则由实际施工人自行承担，挂靠公司原则上不承担责任。但需注意，若实际施工人以挂靠公司名义对外活动，可能构成表见代理，挂靠公司需承担相应责任。

4. 挂靠公司未结清工程款导致实际施工人对外负债
   若因挂靠公司未及时支付工程款，导致实际施工人无法向第三方履行债务（如拖欠农民工工资、材料款），实际施工人可依据《保障农民工工资支付条例》等规定，要求挂靠公司在未结清工程款范围内承担垫付责任，之后挂靠公司可向实际施工人追偿。

建议行动：

• 实际施工人：合同终止后，应与挂靠公司书面确认债务清单及承担方式，保留工程款结算、债务形成等证据，避免个人财产与工程财产混同。
  
• 挂靠公司：需审查实际施工人对外债务是否与工程相关，要求实际施工人提供债务清偿证明，必要时在合同中约定债务隔离条款（如要求实际施工人提供担保）。
  

风险提示：若挂靠行为被认定无效（如违反建筑资质管理规定），实际施工人与挂靠公司可能需根据过错程度共同承担责任，债务处理将更复杂。

如有具体债务纠纷或合同条款需分析，可直接向我咨询。