结论：公司工作日加班，一般应支付加班工资，但在符合法律规定及双方协商一致的情况下，也可以考虑调休。具体能否调休，需结合工时制度、法律规定及双方约定来判断。
一、一般情况下的处理原则
根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，对于实行标准工时制的员工，用人单位在工作日安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的150%的工资报酬。这意味着，工作日加班原则上应支付加班工资，而非强制要求安排调休。然而，法律并未完全排除调休的可能性，如果用人单位与劳动者协商一致，且符合相关法律法规及单位规章制度的要求，也可以考虑以调休作为补偿方式之一。
二、不同工时制度下的特殊处理
综合计算工时工作制：
- 在这种工作制下，某一具体日（或周）的实际工作时间可能超过8小时（或40小时），但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。超过部分视为延长工作时间，应按150%的标准支付工资报酬。
- 通常情况下，此类工作制不存在调休的说法，而是统一核算加班费用。但如果企业与员工有关于调休的特别约定，且不违反法律强制性规定，也可以依约定执行调休。
不定时工作制：
- 对于实行不定时工作制的员工，由于工作时间不固定，一般不存在平时工作日加班以及调休的问题。
- 但若用人单位安排员工在法定节假日工作，则必须按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付工资报酬，且不能以调休来替代支付法定节假日的加班工资。
三、调休安排的注意事项
- 合法约定：若用人单位与劳动者在劳动合同或集体合同中有关于加班调休的特别约定，且该约定符合法律规定，那么在工作日加班后，劳动者有权要求用人单位按照约定安排调休。
- 合理安排：用人单位应当根据实际情况，合理安排调休时间，确保劳动者的休息权利得到保障。调休应当在合理的时间内进行，避免长时间拖延导致劳动者的休息权益受损。
- 权益保障：若用人单位以调休为由拒绝支付加班工资，或者安排不合理的调休时间，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身的合法权益。
四、加班工资的计算标准
若公司选择支付加班工资而非调休，则加班工资的计算标准如下：
- 工作日加班：支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬。计算公式为：\(加班工资 = 小时工资 \times 加班小时数 \times 150\%\)。
- 例如，某员工月工资为5000元，其小时工资约为28.74元（\(5000元/月 \div 21.75天/月 \div 8小时/天\)）。若该员工在工作日加班2小时，则应获得加班费约86.22元（\(28.74元/小时 \times 2小时 \times 150\%\)）。
五、建议与总结
- 建议：对于公司工作日加班的处理，建议用人单位与劳动者充分沟通、协商一致，并严格遵守相关法律法规。在可能的情况下，优先考虑支付加班工资，以确保劳动者的合法权益得到保障。若双方协商一致选择调休，也应确保调休安排的合理性和合法性。
- 总结：公司工作日加班的处理方式并非一成不变，而是需根据具体情况及法律规定来判断。在标准工时制下，通常应支付加班工资；在综合计算工时工作制和不定时工作制下，则需结合具体规定和约定来确定。无论选择哪种方式，都应确保劳动者的合法权益得到充分保障。
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