针对您提出的“入职材料不齐全，离职手续不办理是否合法”的问题，我们可以从两个方面来详细分析：
一、关于入职材料不齐全
入职材料不齐全通常指的是员工在入职时未能按照公司要求提供完整的入职所需文件或资料。这本身并不直接决定离职手续的合法性，但可能会影响公司对员工入职流程的处理以及后续的管理。重要的是，入职材料的齐全与否与离职手续的办理是两个相对独立的过程。即使入职材料不齐全，员工在符合法定条件的情况下，仍然有权提出离职并要求公司办理相应的离职手续。
二、关于离职手续不办理的合法性
法定离职权利： 根据《劳动合同法》第三十七条的规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。在试用期内，劳动者只需提前三日通知用人单位即可解除劳动合同。这意味着，员工在符合法定通知期限的情况下，有权单方面解除劳动合同，无需得到公司的批准。
离职手续的办理： 根据《劳动合同法》第五十条的规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。这是公司的法定义务，必须履行。即使员工入职时材料不齐全，这也不构成公司拒绝办理离职手续的合法理由。
不办理离职手续的后果： 如果公司拒绝为员工办理离职手续，如不出具离职证明、不办理档案和社会保险关系转移等，这将构成违法行为。员工有权向劳动行政部门投诉，或者申请劳动仲裁，要求公司履行其法定义务，并可能因此获得相应的赔偿。
三、综合分析
入职材料不齐全并不影响员工依法提出离职并要求公司办理离职手续的权利。公司不得以入职材料不齐全为由拒绝为员工办理离职手续。如果公司拒绝办理，员工可以通过法律途径维护自己的合法权益。
四、建议
如果您目前面临入职材料不齐全但希望离职的情况，建议您首先与公司沟通，明确告知公司您的离职意愿，并要求公司按照法律规定办理离职手续。
如果公司拒绝办理或提出不合理要求，您可以向当地劳动行政部门投诉，或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
在离职过程中，建议您保留好相关证据，如离职申请、沟通记录等，以便在需要时提供证明。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。