违规超额领工资的处理方式需根据具体情形确定，主要分为以下两种情况：

1. 若超额领取系员工单方过错（如虚报工时、伪造考勤记录等）

   • 法律定性：属于不当得利，用人单位有权要求员工返还超额部分。根据《民法典》第122条，因他人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人有权请求其返还不当利益。
     
   • 操作建议：
     
     • 立即固定证据（如考勤记录、工资条、员工自认超额领取的书面材料等）；
       
     • 通过书面形式（如律师函或内部通知）要求员工限期返还，并明确逾期不还的法律后果（如提起民事诉讼）；
       
     • 若员工拒不返还，可向法院起诉，主张返还超额工资及可能产生的利息损失。
       

2. 若超额领取系用人单位过错（如财务计算错误、未及时调整工资标准等）

   • 法律定性：用人单位需承担管理责任，但仍有权要求员工返还多付部分，但需注意程序合法性。根据《工资支付暂行规定》第16条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
     
   • 操作建议：
     
     • 优先与员工协商返还方案（如分期返还、从后续工资中扣除等），避免激化矛盾；
       
     • 若协商不成，需通过书面形式说明超额领取的原因及返还要求，并留存送达证据；
       
     • 扣除工资时需严格遵守“每月扣除不超过20%”的法定限额，否则可能被认定为违法克扣工资。
       

特殊情形提示：

• 若超额领取涉及贪污、职务侵占等刑事犯罪（如员工利用职务便利篡改系统数据），用人单位应立即向公安机关报案，并配合调查；
  
• 若超额领取系因劳动合同约定不明或工资结构复杂导致争议，建议通过劳动仲裁或诉讼明确责任归属。
  

总结：违规超额领工资的处理需结合过错方、证据充分性及程序合法性综合判断。用人单位应优先通过协商解决，若无法达成一致，需依法主张权利，避免因操作不当引发二次纠纷。如有具体案例或证据材料，可进一步向我说明，我会为您分析具体风险点及应对策略。