保险公司无权单方面决定将对方车损与我方医疗费进行抵扣，这种做法缺乏法律依据，您有权拒绝并要求保险公司按照法定程序处理赔偿事宜。以下从不同角度为您详细分析：

从保险合同法律关系角度

1. 合同相对性原则：保险合同是您与保险公司之间签订的，具有相对性。对方的车损赔偿是基于对方与保险公司（若对方也有保险）或您之间的法律关系，而我方的医疗费赔偿是基于您与保险公司之间的保险合同约定。这两者属于不同的法律关系和赔偿范畴，保险公司不能随意将它们进行抵扣。
2. 合同条款约定：您需要仔细查看您与保险公司签订的保险合同条款。合同中通常会明确规定赔偿的范围、方式、程序等内容。如果合同中没有明确约定可以将对方车损与我方医疗费进行抵扣，那么保险公司的这种做法就是违反合同约定的，您有权依据合同要求保险公司按照正常流程进行赔偿。

从侵权责任法律关系角度

1. 侵权责任的独立性：在交通事故中，如果对方存在过错导致您受伤，对方应承担相应的侵权责任，赔偿您的医疗费等损失；同样，如果您对对方的车损存在过错，您也应承担相应的赔偿责任。这两种侵权责任是相互独立的，不能简单地相互抵扣。
2. 赔偿顺序和方式：一般情况下，应先由交强险在责任限额内进行赔偿，不足部分由商业险按照合同约定进行赔偿，仍有不足的由侵权人进行赔偿。保险公司不能自行改变赔偿顺序和方式，将对方车损与我方医疗费进行抵扣。

应对措施

1. 与保险公司沟通：您可以首先与保险公司进行沟通，明确指出其抵扣做法的错误性，要求保险公司按照保险合同和法律规定进行赔偿。在沟通时，您可以引用相关的法律条款和合同约定，增强自己的说服力。
2. 向监管部门投诉：如果与保险公司沟通无果，您可以向当地的保险监管部门投诉。保险监管部门有权对保险公司的违规行为进行查处，并要求保险公司纠正错误做法，保障您的合法权益。
3. 寻求法律途径解决：如果通过上述方式仍无法解决问题，您可以考虑通过法律途径解决。您可以向法院提起诉讼，要求保险公司按照法律规定和合同约定进行赔偿。在诉讼过程中，您需要提供相关的证据，如保险合同、交通事故责任认定书、医疗费发票等，以证明自己的主张。

如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。