结论：农村工程能否由村支书配偶承包，不能一概而论，需结合具体情况判断，关键在于是否违反回避制度和招投标相关规定。以下从不同角度详细分析：
从回避制度角度分析
- 若村支书在工程决策、审批等环节有职权：
- 根据相关规定，村支书作为村里的重要管理人员，在涉及农村工程承包等事项中，如果其配偶参与承包，村支书可能存在利用职权为配偶谋取利益的风险。为了避免这种利益冲突和不公平现象，村支书应当回避，其配偶一般不能直接承包该工程。例如，在一个农村道路修建工程中，村支书负责工程的招标审批工作，如果其配偶参与投标，村支书就不能参与该工程的审批决策过程，否则就违反了回避制度，可能导致工程承包结果不公正，损害其他投标人的利益。
- 若村支书在工程中无职权：
- 如果村支书在农村工程的决策、审批、管理等环节没有任何职权，其配偶承包工程在回避制度方面可能不存在问题。但即便如此，也需要确保整个承包过程符合其他相关规定，如招投标程序等。比如，村支书只是负责村里的文化活动组织，与农村工程没有任何关联，其配偶通过合法的招投标程序承包工程，这种情况下从回避制度角度是可行的。
从招投标相关规定角度分析
- 工程必须进行招投标的情况：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》等相关法律法规，对于一定规模以上的农村工程，如基础设施建设、土地整治等项目，通常需要进行公开招投标。在招投标过程中，要求公平、公正、公开，所有符合条件的投标人都应享有平等的机会。如果村支书配偶参与投标，必须严格按照招投标程序进行，不能因为与村支书的关系而获得特殊照顾。例如，一个农村水利灌溉工程，按照规定需要进行公开招投标，村支书配偶参与投标时，需要和其他投标人一样提交投标文件，经过评标委员会的评审等环节，如果其投标文件不符合要求或者存在违规行为，同样不能中标。
- 工程可以不进行招投标的情况：
- 对于一些规模较小、技术要求不高的农村工程，可能可以不进行招投标。但即使在这种情况下，也不能违反相关规定和公平原则。村支书配偶承包工程时，需要经过村民会议或者村民代表会议的讨论和同意，确保整个过程公开透明，接受村民的监督。比如，一个农村的小型垃圾清理工程，经村民会议讨论决定不进行招投标，而是直接选择合适的承包人，此时村支书配偶要承包该工程，需要得到村民的认可，不能强行承包。
建议：为了避免不必要的纠纷和法律风险，在农村工程承包过程中，无论是村支书还是其配偶，都应当严格遵守相关法律法规和回避制度。如果村支书配偶有意承包农村工程，最好提前了解工程的具体情况、招投标要求等，确保整个承包过程合法合规。如果对相关问题存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供详细的法律建议。