合同里面可以约定按照单位内部协议执行，但这一约定需满足一定的条件并受到一定的限制。以下从不同角度为你详细分析：
一、合同自由原则下的合法性
根据合同自由原则，合同双方有权在平等、自愿的基础上，就合同的内容进行协商并达成一致。因此，从原则上讲，合同中可以约定按照单位内部协议执行，只要这一约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且是双方真实意思的表示。
二、单位内部协议的性质与效力
内部性：单位内部协议通常是单位与其员工之间，或者单位内部各部门之间就特定事项达成的协议。这些协议往往具有内部性，即它们主要调整单位内部的关系，不对外部第三人产生直接的法律效力。
效力范围：如果合同双方都是单位内部的成员，且合同内容与单位内部协议直接相关，那么约定按照单位内部协议执行是合理的。但如果合同一方是外部第三人，那么单位内部协议对其通常不具有约束力，除非该第三人明确表示同意受该内部协议的约束。
三、约定按照单位内部协议执行需注意的问题
明确性：合同中应明确约定按照哪一份单位内部协议执行，以及该协议的具体内容。如果合同中的约定过于模糊或含糊不清，可能导致双方在履行合同过程中产生争议。
合法性审查：在约定按照单位内部协议执行前，应对该协议进行合法性审查。确保该协议不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。如果单位内部协议本身存在违法或违规内容，那么以此为基础的合同约定也可能被认定为无效。
外部第三人同意：如果合同涉及外部第三人，且约定按照单位内部协议执行，那么应确保该第三人明确表示同意受该内部协议的约束。否则，该约定可能对该第三人不产生法律效力。
四、法律后果
如果合同中约定按照单位内部协议执行，但未满足上述条件或受到限制，可能导致以下法律后果：
合同无效：如果约定违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗，那么该约定可能被认定为无效，进而影响整个合同的效力。
争议解决困难：如果合同中的约定过于模糊或含糊不清，可能导致双方在履行合同过程中产生争议，且难以通过协商或诉讼等方式解决。
外部第三人权益受损：如果合同涉及外部第三人，且未经其同意约定按照单位内部协议执行，可能损害该第三人的合法权益，进而引发法律纠纷。
建议：在签订合同时，如果涉及约定按照单位内部协议执行，应谨慎对待并确保满足相关条件。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。