公务员担任合作社法人通常存在限制和影响，具体分析如下：

1. 法律与纪律层面的限制
   根据《公务员法》第五十九条，公务员不得“违反有关规定从事或者参与营利性活动，在企业或者其他营利性组织中兼任职务”。合作社虽属于互助性经济组织，但若其从事营利性经营活动（如经营性种植、养殖、加工、销售等），公务员担任法人可能被认定为违规兼职，面临警告、记过甚至撤职等处分。
   例外情形：若合作社完全以非营利为目的（如纯农业技术互助、扶贫合作等），且未从事任何营利性活动，可能不构成违规。但实践中此类合作社极少，需严格审查章程和实际运营情况。

2. 利益冲突与公正性风险
   公务员的职责是公共管理，若同时担任合作社法人，可能因合作社利益与公共利益产生冲突。例如：

• 合作社申请政府补贴或项目时，公务员身份可能引发“既当裁判又当运动员”的质疑；
  
• 合作社与其他市场主体竞争时，公务员可能利用职务便利为其谋取优势，涉嫌违反《刑法》中的“滥用职权罪”或“受贿罪”（若涉及利益输送）。

1. 实际运营中的合规风险
   即使合作社未从事营利性活动，公务员担任法人仍需注意：
   

• 审批与备案：部分地区要求公务员兼职需经单位批准并备案，未履行程序可能构成违纪；
  
• 时间冲突：公务员需确保履行本职工作，若因合作社事务影响工作，可能被追究责任；
  
• 财务独立：合作社资金需与公务员个人财产严格分离，避免混同导致贪污或挪用公款嫌疑。

建议：

1. 若已担任合作社法人，应立即审查合作社性质及实际运营内容，若涉及营利性活动，建议辞去法人职务；
   
2. 若计划担任法人，需提前向单位申报并获得批准，同时确保合作社完全非营利化；
   
3. 无论何种情况，均需避免利用公务员身份为合作社谋取不正当利益。
   

如有具体案例或地区政策疑问，可进一步向我咨询。