针对您提出的“个人公务卡出差购机票1000元，谁来还款”的问题，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确的是，当使用个人公务卡购买公务机票时，这张机票的费用实际上是由单位承担的，而不是个人。公务卡是单位为公务人员办理的一种用于公务消费的银行卡，其消费记录会与单位的财务系统相关联，以便进行后续的报销和结算。
具体到您的情况，当您使用个人公务卡购买了1000元的公务机票后，这笔费用会先从您的公务卡账户中扣除。但是，这并不意味着您需要个人承担这笔费用。按照公务卡的使用规定和单位的财务管理制度，您可以在出差结束后，将相关的消费凭证（如机票行程单、公务卡消费记录等）提交给单位的财务部门进行报销。
单位财务部门在审核您的报销申请后，如果确认这笔费用是合理的公务消费，就会将相应的款项支付到您的公务卡账户中，或者通过其他方式（如银行转账）将款项返还给您。这样，您实际上并没有个人承担这笔机票的费用。
此外，我还想提醒您注意以下几点：
在使用公务卡购买机票时，请确保公务卡已经开通且在有效期内，以便顺利完成消费和报销流程。
购买机票时，请选择符合单位规定的购票渠道和票价类型，以避免不必要的麻烦和费用。
在出差结束后，请及时整理并提交相关的消费凭证和报销申请，以便单位财务部门能够及时处理您的报销事宜。
综上所述，当您使用个人公务卡购买公务机票时，虽然费用会先从您的公务卡账户中扣除，但最终是由单位承担这笔费用的。您只需按照单位的财务管理制度提交相关的报销申请和消费凭证即可。