结论：公司提交的工伤认定证人证言，在正常情况下，不会反过来说员工有故意自残的嫌疑，但也不能完全排除这种可能性，具体需结合证人证言的内容、目的以及相关法律规定来综合判断。以下从多个角度进行分析：
一、证人证言的基本性质与目的
证人证言是工伤认定过程中的一种重要证据形式，其主要目的是为了证明工伤事故的发生经过、原因以及员工的受伤情况等事实。在正常情况下，证人证言应当客观、真实地反映事故情况，为工伤认定提供有力的支持。因此，从证人证言的基本性质和目的来看，它通常不会反过来说员工有故意自残的嫌疑。
二、证人证言可能被误用或曲解的情况
证人主观偏见：如果证人本身对员工存在偏见或不满，可能会在证言中故意夸大或歪曲事实，甚至捏造员工故意自残的情节。然而，这种情况在工伤认定过程中是较为少见的，因为证人证言需要经过劳动保障行政部门的审查和核实，且证人需要承担作伪证的法律责任。
证据收集不全面：如果工伤认定过程中收集的证据不全面，或者只收集了部分对员工不利的证据，而忽略了其他关键证据，那么证人证言可能会被误用或曲解，从而得出对员工不利的结论。但这种情况并非证人证言本身的问题，而是证据收集和处理过程中的问题。
三、法律对证人证言的规定与限制
证人资格与义务：根据相关法律规定，证人应当具备作证的能力，并如实提供证言。证人不得作伪证或隐瞒事实真相，否则将承担相应的法律责任。这一规定确保了证人证言的真实性和可靠性。
证据审查与核实：劳动保障行政部门在工伤认定过程中，会对收集到的证据进行审查和核实。如果证人证言存在矛盾或不合理之处，或者与其他证据相矛盾，那么该证言可能会被排除或不予采信。
举证责任分配：在工伤认定过程中，用人单位承担举证责任。如果用人单位认为员工存在故意自残的行为，需要提供充分的证据来支持其主张。否则，仅凭证人证言是无法认定员工存在故意自残行为的。
四、员工应对策略与建议
积极收集证据：员工在工伤事故发生后，应积极收集相关证据，包括现场照片、视频、医疗记录等，以证明事故的真实性和自己的受伤情况。
保持冷静与理性：面对公司可能提出的证人证言或其他不利证据，员工应保持冷静与理性，不要轻易相信或传播未经证实的信息。
寻求法律帮助：如果员工对工伤认定过程或结果存在异议，或者认为公司提交的证人证言存在不实之处，可以及时向我咨询或寻求其他法律帮助，以维护自己的合法权益。
总结：公司提交的工伤认定证人证言在正常情况下不会反过来说员工有故意自残的嫌疑。但员工仍需保持警惕，积极收集证据并寻求法律帮助，以应对可能出现的复杂情况。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。