针对您提出的问题，即“儿子的户口上在妈妈那边，爸爸做亲子鉴定迁过去是否需要妈妈同意”，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，户口迁移是一个涉及家庭成员共同权益的事项，尤其是当涉及到未成年子女的户口迁移时，通常需要父母双方的共同同意和参与。这是因为未成年子女在法律上属于无民事行为能力人或限制民事行为能力人，他们的权益需要由父母或其他法定监护人来保护。

在您所描述的情况下，儿子的户口目前上在妈妈那边，如果爸爸希望将儿子的户口迁移到自己名下，并且打算通过亲子鉴定来证明父子关系，那么这一行为仍然需要妈妈的同意。这是因为户口迁移不仅仅是一个简单的行政手续，它还涉及到家庭关系的变更和子女权益的保障。

具体来说，户口迁移通常需要提供一系列的材料，包括但不限于入户申请表、父母双方的居民户口簿和居民身份证、未成年子女的居民户口簿（如适用）、出生医学证明、以及可能需要的亲子鉴定报告等。然而，在这些材料之外，更重要的是父母双方的共同意愿和同意。因为户口迁移后，子女将与新的户主（在这里是爸爸）形成法律上的亲属关系，这可能会影响到子女的教育、医疗、继承等权益。

因此，为了确保子女的权益得到充分保障，以及避免未来可能出现的家庭纠纷，爸爸在希望将儿子的户口迁移到自己名下时，应该与妈妈进行充分沟通，并取得她的同意。如果双方能够达成一致意见，那么可以共同前往公安机关办理户口迁移手续。

最后，我想强调的是，家庭关系的和谐与稳定对于子女的成长至关重要。在处理户口迁移等涉及家庭成员共同权益的事项时，我们应该秉持着相互理解、相互尊重的原则，通过沟通协商来达成共识，以维护家庭的和谐与稳定。