若个人已做认罪认罚而单位未被认定，需分情况讨论处理方式，核心在于明确单位是否构成犯罪及个人与单位犯罪的关联性，具体分析如下：

1. 单位不构成犯罪的情形
   若经司法机关审查，单位行为不符合单位犯罪的构成要件（如缺乏单位意志、未以单位名义实施、利益未归属于单位等），则单位不构成犯罪。此时：

   • 个人认罪认罚的效力：个人认罪认罚仅针对其自身行为，不影响单位责任认定。个人仍需承担刑事责任，但单位不涉及刑事程序。
     
   • 后续程序：个人可依据认罪认罚从宽制度获得量刑优惠，但需注意单位不构成犯罪不影响个人罪名的成立。若个人认为单位行为应被认定，可申请补充侦查或提出辩护意见，但需提供充分证据证明单位存在犯罪故意及行为。

2. 单位构成犯罪但未被认定的情形
   若单位行为实际构成犯罪，但因证据不足、程序瑕疵或司法机关未主动追诉等原因未被认定，需区分以下情况：

   • 个人与单位犯罪的关联性：若个人是单位犯罪的直接责任人员（如主管人员或直接实施人员），其认罪认罚可能被视为对单位犯罪部分事实的承认，但单位整体责任仍需独立认定。此时可申请启动单位犯罪侦查程序，或通过辩护人提交单位犯罪证据（如单位决策记录、财务凭证等）。
     
   • 程序救济途径：根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，若发现单位犯罪线索，可向检察机关提出立案监督申请，或通过审判阶段补充起诉程序追加单位为被告。需注意，单位犯罪的追诉需以单位名义实施、体现单位意志且利益归属于单位为前提。

3. 实务建议

   • 证据固定：个人应保留与单位行为相关的书面材料（如合同、审批文件、会议记录）、电子数据（如邮件、聊天记录）及证人联系方式，以证明单位存在犯罪故意及行为。
     
   • 辩护策略：若单位未被认定影响个人量刑（如从犯认定、责任分担），可在认罪认罚具结书中明确提出异议，或通过辩护人主张单位责任对个人量刑的影响。
     
   • 程序参与：积极配合司法机关对单位行为的调查，必要时申请作为证人或被害人参与单位犯罪程序，推动单位责任认定。

总结：个人认罪认罚与单位责任认定是独立程序，单位未被认定不必然影响个人量刑，但可能涉及责任分担问题。建议根据单位行为性质、证据情况及程序阶段，选择合适策略推动单位责任认定或调整个人辩护方向。如有具体案件细节，可进一步提供信息以便针对性分析。