非国家工作人员职务侵占罪由公安机关立案侦查。以下是对这一问题的详细解答：
一、立案主体
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十九条的规定，刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。非国家工作人员职务侵占罪并不属于人民检察院、国家安全机关等专门机关管辖的案件范围，因此，应由犯罪地的公安机关或者犯罪嫌疑人居住地的公安机关管辖。如果由犯罪嫌疑人居住地的公安机关管辖更为适宜的，也可以由其管辖。
二、立案标准
非国家工作人员职务侵占罪的立案标准主要依据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释来确定。具体来说：
数额较大标准：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条第一款及《最高人民法院、最高人民检察院关于办理贪污贿赂刑事案件适用法律若干问题的解释》第十一条规定，非国家工作人员利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额达到6万元及以上的，应予立案追诉。这是基本的立案门槛。
数额巨大标准：
- 若侵占数额达到100万元以上，则被视为“数额巨大”，将面临更严厉的法律制裁，包括三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
其他立案情形：
- 除了基于侵占数额的大小，还有以下几种特殊情形也应予以立案追诉：
- 数额在1万元以上不满6万元，但具有曾因贪污、受贿、挪用公款等受过党纪、行政处分，或因故意犯罪被刑事处罚等情形的。
- 多次实施职务侵占行为，虽然每次未达到上述数额标准，但累计数额达到3万元以上的。
- 曾因职务侵占行为受过两次以上行政处罚，又实施职务侵占行为的，无论数额大小。
三、立案流程
报案或举报：
- 单位或个人发现职务侵占行为后，可以向公安机关报案或举报。报案时应提供尽可能详细的证据材料，如财务记录、监控录像、证人证言等，以证明犯罪事实的存在和犯罪嫌疑人的身份。
初步审查：
- 公安机关接到报案后，会进行初步审查，判断是否符合立案条件。这包括核实报案人的身份、了解案件基本情况、评估证据材料的真实性和充分性等。
立案决定：
- 如果认为有犯罪事实需要追究刑事责任，且属于自己管辖的范围，公安机关会作出立案决定。此时，案件正式进入侦查阶段。
侦查取证：
- 公安机关会依法对案件进行调查取证，收集能够证明犯罪嫌疑人实施职务侵占行为的证据。这可能包括询问相关人员、调取财务资料、查封扣押涉案财物等。
四、注意事项
- 在报案前，公司应尽可能收集全面、客观的证据材料，以证明犯罪事实的存在和犯罪嫌疑人的身份。
- 对于不同性质的单位（如国有与非国有）和人员（如公务人员与非公务人员），其职务侵占行为的法律性质和立案机关可能有所不同，因此需根据实际情况选择正确的报案途径。
作为专业律师，我建议你在面对此类问题时，应充分了解相关法律法规和程序要求，确保报案的准确性和有效性。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。