在提离职申请时，为了保留证据以维护自身权益，你可以采取以下详细且具有深度的措施：
一、书面形式提交离职申请
撰写离职申请书：明确表达你的离职意愿，并详细列出离职的原因、预计离职日期等关键信息。确保申请书内容清晰、准确，避免使用模糊或含糊不清的措辞。
签名并注明日期：在离职申请书的末尾，亲笔签名并注明提交日期。这是证明你提出离职申请的重要证据。
二、保留离职申请的副本
复印或扫描：在提交离职申请书之前，先复印或扫描一份留存。这样，即使原件丢失或损坏，你仍有副本作为证据。
电子备份：将复印或扫描的副本保存在电脑或云存储中，以便随时查阅和打印。
三、通过正式渠道提交离职申请
直接交给上级或人力资源部门：将离职申请书直接交给你的上级或人力资源部门负责人，并要求对方在接收时签字确认。如果对方拒绝签字，你可以请其他同事在场见证，或者通过邮件、短信等方式再次确认提交事宜。
邮件提交：如果公司允许或你更倾向于通过邮件提交离职申请，那么请确保邮件内容完整、清晰，并附上离职申请书的电子版。在邮件中明确表达你的离职意愿和预计离职日期，并请求对方回复确认收到。
四、保留与离职相关的沟通记录
邮件、短信、微信等聊天记录：如果你与上级或人力资源部门就离职事宜进行了沟通，请保留这些聊天记录作为证据。这些记录可以证明你提出离职申请的过程以及公司的回应。
录音或录像：在极端情况下，如果你担心公司可能会否认你提出离职申请的事实，你可以考虑在提交离职申请时进行录音或录像。但请注意，在录音或录像前应确保符合当地法律法规的要求，并尊重他人的隐私权。
五、关注离职流程的后续进展
确认离职日期：与公司确认你的离职日期，并确保这一日期与你在离职申请书中提出的日期一致。如果公司提出更改离职日期，请要求对方给出合理的解释，并保留相关沟通记录。
办理离职手续：按照公司的要求办理离职手续，如交接工作、归还公司财物等。在办理过程中，请保留相关证据，如交接清单、归还凭证等。
六、法律层面的建议
了解相关法律法规：在提离职申请前，了解《劳动法》、《劳动合同法》等相关法律法规中关于离职的规定。这有助于你更好地维护自己的权益，并在必要时寻求法律援助。
咨询专业律师：如果你对离职流程或相关法律法规存在疑问，或者担心公司可能会采取不正当手段阻碍你离职，你可以咨询专业律师的意见。律师可以为你提供专业的法律建议，并帮助你制定合适的离职策略。
通过以上措施，你可以有效地保留提离职申请的证据，并在必要时维护自己的合法权益。记住，在离职过程中保持冷静和理性，与公司进行友好沟通，是解决问题的最佳方式。