核心结论：针对亲戚占用自家土地但协议书未写清楚面积的情况，可通过协商补充、收集证据、第三方介入或法律途径解决，具体如下：

1. 协商补充协议
   首先建议与亲戚进行友好协商，明确土地的具体面积、边界及使用期限等关键条款，并签订补充协议。补充协议需双方签字确认，必要时可邀请第三方（如村委会、居委会或中立亲属）作为见证人，以增强协议的证明力。若涉及土地权属证书（如宅基地证、土地承包经营权证），可核对证书上的面积与实际使用情况，确保补充协议内容与权属登记一致。

2. 收集证据固定事实
   若协商未果，需通过证据还原事实：

   • 权属证明：提供土地证、承包合同、分家协议等官方文件，证明土地归属；
     
   • 使用痕迹：收集土地现状照片、视频、卫星地图截图，或邻居、村民的证人证言，证明实际占用情况；
     
   • 历史记录：如曾有书面或口头约定（如分家时口头划分），可寻找相关证据（如录音、聊天记录）辅助证明。
     证据需形成完整链条，以支持己方对土地面积的主张。

3. 申请第三方介入调解
   可向当地人民调解委员会、村委会或司法所申请调解，由第三方中立机构协助双方明确面积、划分边界，并出具调解协议。调解协议经双方签字后具有法律效力，若一方不履行，可申请法院强制执行。此方式成本较低，且能维护亲属关系。

4. 通过法律途径解决争议
   若上述方法均无效，可向法院提起确认合同效力之诉或物权保护之诉，要求法院根据证据判定土地实际面积及归属。诉讼中需注意：

   • 举证责任：主张权利的一方需承担主要举证责任，证明土地权属及占用事实；
     
   • 现场勘验：法院可能委托测绘机构对土地进行实地测量，以确定具体面积；
     
   • 判决效力：法院判决具有强制执行力，可彻底解决争议，但可能耗费较长时间及成本。

风险提示：若土地涉及集体所有或国家征收，需提前确认土地性质及政策限制，避免因违规使用导致协议无效。建议根据争议复杂程度选择合适方案，必要时可携带相关材料进一步向我咨询具体操作细节。