合同约定与政府指导价的关系需分情况讨论，具体结论如下：

1. 若合同明确约定“按政府指导价执行”
   此时合同条款与政府指导价直接挂钩，双方需严格遵循政府发布的指导价标准。例如：

   • 政府对某类商品或服务设定了最高限价或基准价，合同中约定“按政府指导价结算”的，应以指导价为准；
     
   • 若政府调整指导价，合同价格通常需同步调整（除非合同另有约定，如“固定价格不受指导价变动影响”）。
     关键点：合同条款需明确引用政府指导价的具体文件或范围，否则可能因约定不明引发争议。

2. 若合同未明确约定政府指导价，但涉及政府定价项目
   根据《中华人民共和国民法典》第五百一十三条，若合同标的属于政府定价或政府指导价范围（如公用事业、公益服务等领域），即使合同未约定，仍应优先适用政府定价/指导价。
   例外情形：若政府已放开价格管制（如取消指导价），则按市场价或合同约定执行。

3. 合同约定与政府指导价冲突时的处理

   • 若合同约定价格低于政府指导价（如最低限价），可能因违反强制性规定被认定无效，需按指导价执行；
     
   • 若合同约定价格高于政府指导价（如最高限价），超出部分可能无效，但若政府允许市场调节价或双方通过补充协议修正，则可能有效。
     建议：签订合同时需核查标的是否属于政府定价/指导价范围，避免条款违法。

总结：合同能否直接“按政府指导价计算”取决于条款约定及标的性质。若涉及政府定价项目，即使合同未约定，也可能受指导价约束；若合同已明确约定且不违法，则按约定执行。如有具体合同或行业场景，可进一步向我说明，我会结合细节分析。