合同作假虚开发票属于严重的违法行为，可能涉及刑事犯罪和行政处罚，需根据具体情节承担相应法律责任。以下从法律定性、责任承担、处理流程三个角度展开分析：

一、法律定性：合同作假与虚开发票的关联性

1. 合同作假：指通过伪造、变造合同内容（如虚构交易标的、金额、履行方式等），或使用虚假合同掩盖真实交易目的，属于《刑法》中的“欺诈行为”，可能构成合同诈骗罪（若以非法占有为目的）或诈骗罪。
2. 虚开发票：指为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，包括无真实交易虚开、虚开金额或数量、让他人代开等行为，违反《发票管理办法》及《刑法》第二百零五条（虚开增值税专用发票罪）。
3. 关联性：若合同作假的目的系为虚开发票提供“表面合法性”（如虚构交易以匹配虚开发票内容），则两者构成手段与目的的牵连关系，可能被认定为共同违法行为或数罪并罚。

二、责任承担：刑事与行政双重风险

1. 刑事责任：

   • 合同诈骗罪：若以非法占有为目的，通过虚假合同骗取财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金；数额巨大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
   • 虚开发票罪：
     • 虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，处三年以下有期徒刑或拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；数额较大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。
     • 虚开普通发票（如增值税普通发票）情节严重的，处二年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金；情节特别严重的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
   • 数罪并罚：若合同作假与虚开发票行为独立构成犯罪，或为实施犯罪而互相配合，可能面临数罪并罚。

2. 行政责任：

   • 税务机关可对虚开发票行为处以罚款（如虚开金额1倍以下的罚款），并没收违法所得。
   • 若涉及偷逃税款，需补缴税款、滞纳金，并处偷税数额50%至5倍的罚款。
   • 合同作假可能被市场监管部门认定为“不正当竞争”或“欺诈行为”，处以警告、罚款或吊销营业执照等处罚。

三、处理流程：自查、配合调查与法律救济

1. 自查与整改：

   • 立即停止违法行为，梳理虚假合同及虚开发票的具体情况（如金额、涉及方、资金流向等）。
   • 评估是否已造成国家税款损失或他人财产损失，主动补缴税款、退还非法所得，以争取从轻处理。

2. 配合调查：

   • 若被税务、公安等部门立案调查，需如实提供账目、合同、沟通记录等证据，避免隐瞒或伪造证据导致罪责加重。
   • 委托律师介入，协助与执法机关沟通，制定辩护策略（如主张无主观故意、情节轻微等）。

3. 法律救济：

   • 若对行政处罚不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
   • 若涉嫌刑事犯罪，律师可协助申请取保候审、争取缓刑或量刑减免（如自首、立功、认罪认罚等）。

四、实务建议：预防优于补救

1. 企业合规：
   • 建立合同审核机制，确保交易真实、条款合法，避免使用模糊或可篡改的合同模板。
   • 规范发票管理流程，要求提供与实际业务一致的发票，禁止“买票”“卖票”或“挂靠开票”。
2. 个人风险防范：
   • 拒绝参与任何形式的虚开发票行为，即使对方承诺“安全”或“有好处”。
   • 发现他人虚开发票时，及时向税务机关举报（可匿名），避免被牵连。

提示：合同作假与虚开发票的后果极其严重，轻则行政处罚，重则刑事追责。若您或您的企业涉及此类问题，建议立即停止违法行为，并携带相关材料向我详细咨询，我将根据具体情节制定应对方案。