结论前置：您开车撞死人后，即便自行协商并办公证，检察院仍起诉您，这并不意味着协商和公证无效，而是案件可能涉及刑事责任，需通过法律程序来认定。接下来，我将从多个角度为您详细分析后续应如何应对。

1. 理解检察院起诉的原因：

   • 检察院起诉通常意味着案件涉及刑事责任。在交通事故中，如果造成人员死亡，且驾驶员存在过错（如超速、酒驾、违规驾驶等），就可能构成交通肇事罪。即便您与受害者家属已经自行协商并办公证，这并不能免除您的刑事责任。公证主要证明的是民事赔偿协议的合法性和有效性，但无法替代刑事责任的追究。

2. 刑事责任的认定与程序：

   • 检察院起诉后，案件将进入刑事诉讼程序。您需要配合法院的调查和审判工作，包括接受讯问、提供证据等。
   • 法院将根据事实和法律，认定您是否构成交通肇事罪，以及罪行的轻重。如果构成犯罪，法院将依法判处刑罚，如有期徒刑、拘役或罚金等。

3. 民事赔偿与刑事责任的关系：

   • 即便您已经与受害者家属协商并支付了民事赔偿，这并不能作为免除刑事责任的依据。但民事赔偿的积极态度和处理结果，可能会在法院量刑时作为考虑因素，对减轻刑罚有一定帮助。
   • 如果民事赔偿协议已经公证，且您已经按照协议履行了赔偿义务，这可以作为您积极承担民事责任的证明，在刑事诉讼中可能对您有利。

4. 后续应对策略：

   • 积极配合调查：如实向警方和检察院提供事故经过、自己的驾驶情况等相关信息，配合调查工作。
   • 寻求法律援助：聘请一位有经验的刑事辩护律师，为您在刑事诉讼中提供法律帮助和辩护。
   • 关注案件进展：及时了解案件的进展情况，包括检察院的起诉意见、法院的开庭时间等，以便做好应对准备。
   • 准备证据材料：收集并整理与案件相关的证据材料，如事故现场照片、监控录像、证人证言等，以支持自己的辩护。

5. 可能的法律后果：

   • 如果法院认定您构成交通肇事罪，您将面临刑罚的处罚。具体刑罚的轻重将取决于罪行的轻重、您的认罪态度、民事赔偿情况等因素。
   • 即便您被判处刑罚，如果民事赔偿协议已经公证且履行完毕，受害者家属通常不能再就民事赔偿部分向您提出额外要求。

最后建议：面对检察院的起诉，您应保持冷静，积极配合法律程序，寻求专业的法律帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。