核心结论：公司股东因职务侵占导致其他股东要求退还股金，需通过合法程序明确责任、确定退还方式并形成书面协议，具体操作需结合公司章程、股东协议及法律规定进行。以下从法律程序、协议内容、注意事项三个角度展开说明：

1. 法律程序：先确认职务侵占事实，再主张退还股金

• 职务侵占的认定：根据《刑法》第271条，职务侵占需满足“利用职务便利+侵占公司财物+数额较大”三个要件。若股东行为构成犯罪，其他股东可先向公安机关报案，通过刑事程序追缴赃款并返还公司，再由公司根据章程或股东协议处理股金退还问题。
• 民事救济路径：若不构成犯罪或需快速解决，其他股东可依据《公司法》第20条（股东滥用权利赔偿）或第152条（股东代表诉讼），以公司名义起诉侵占股东，要求其赔偿公司损失。赔偿款到位后，公司可按章程约定退还股金或调整股权结构。

2. 协议内容：退还股金协议需明确关键条款

• 退还主体与对象：协议需明确是公司退还股金（需公司决议）还是侵占股东直接赔偿其他股东（需其他股东一致同意）。
• 退还金额与方式：
  • 若股金已投入公司且未抽逃，退还金额应为股东实际出资额（需审计确认公司资产状况）；
  • 若侵占行为导致公司资产减少，退还金额可能需扣除侵占部分对应的损失；
  • 支付方式可约定一次性或分期退还，并明确逾期违约金。
• 股权处理：退还股金后，需明确股权是转让给其他股东、第三方还是由公司回购（需符合《公司法》第74条回购条件）。
• 生效条件：可约定协议以刑事判决、民事赔偿到位或公司决议通过为生效条件，避免执行风险。

3. 注意事项：避免程序瑕疵导致协议无效

• 公司章程优先：若章程对股金退还有特殊规定（如锁定期、退股程序），需优先遵守，否则可能被认定为无效。
• 股东会决议：若涉及公司退还股金或回购股权，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过，并形成书面决议。
• 税务合规：股金退还可能涉及个人所得税（如视为分红）或企业所得税（如公司回购股权），需提前咨询税务机关并代扣代缴。
• 公证与登记：协议签署后建议公证，并办理工商变更登记（如涉及股权转让），确保对抗第三人效力。

示例条款（供参考）：
“甲方（侵占股东）同意于本协议生效后30日内，向乙方（其他股东）退还股金人民币XX万元，该款项来源于甲方对公司的赔偿款。若甲方未按期支付，每逾期一日按未付金额的0.05%支付违约金。退还股金后，甲方持有公司X%的股权自动转让给乙方，双方配合办理工商变更登记。”

如有具体案件细节（如侵占金额、公司类型、章程约定等），可进一步向我咨询，我将结合实际情况提供定制化方案。