劳动法并未明确规定公司不能扣员工旷工一天当扣三天工资，但“旷工一天扣三天工资”的做法通常缺乏明确的法律依据，且可能构成变相克扣劳动者工资，违反相关法律法规。以下从多个角度为你详细分析：

法律依据层面

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：明确规定工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是保障劳动者获得劳动报酬的基本法律条款，用人单位必须按照约定支付劳动报酬，任何扣款行为都需有法定依据。若用人单位随意以旷工为由扣除劳动者多倍工资，很可能构成无故克扣工资。
2. 《工资支付暂行规定》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。该条款仅允许在特定情形下有限度扣款，且未授权“旷一罚三”的惩罚性扣款。例如，某员工日薪300元，若因旷工给公司造成一定损失，公司最多只能扣除当月工资的20%，而不能直接扣除900元（旷工一天扣三天工资）。
3. 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。这也强调了用人单位足额支付工资的义务。

合理性分析层面

1. 违反比例原则：旷工行为与三倍工资的处罚明显失衡。比如上述例子中员工日薪300元，旷工一天被扣900元，这种远超实际损失的处罚既不合理也不公平。
2. 涉嫌变相罚款：根据《行政处罚法》，罚款权专属于行政机关。企业自行设定高额扣款实质构成非法罚款，可能引发劳动纠纷。
3. 损害劳动关系：过度扣款会激化劳资矛盾，降低员工归属感。有数据显示，采用合理考勤制度的企业员工流失率比实施惩罚性扣款的企业低37%。

用人单位内部规章制度层面

虽然《劳动法》未对旷工行为做出具体规定，但用人单位有权根据自身情况制定内部规章制度。不过，这些制度必须合法、合理，并向员工进行公示或告知，员工也有权了解并遵守这些制度。用人单位在制定旷工扣罚规定时，应确保不违反《劳动法》及《工资支付暂行规定》的相关要求，即扣罚不能超出法律规定的范围。例如，用人单位可以在规章制度中明确旷工的认定标准和处分梯度，如首次警告、二次扣发当日工资、三次解除劳动合同等，但不能直接规定旷工一天扣三天工资。

劳动者维权途径层面

若劳动者认为用人单位以旷工为由扣发过多工资，可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：首先可与用人单位协商，要求其按法律规定支付工资。
2. 向劳动监察部门投诉：协商不成时，劳动者可向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位限期支付克扣的工资。
3. 申请劳动仲裁：劳动者还可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服的，可进一步向人民法院提起诉讼。

建议：用人单位在制定相关规章制度时，应严格遵守法律法规，确保扣罚规定的合法性。劳动者在面对不合理的扣罚时，应积极维护自己的合法权益，通过合法途径进行申诉。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，欢迎直接向我咨询。