事业单位在职在编的工作人员值班不在岗，其处理方式需根据具体情况及单位规章制度、法律法规来综合判断，但通常可能面临警告、记过、解除聘用合同等处分。以下从多个角度详细分析：

一、处理原则

1. 依法依规：处理必须严格遵守《事业单位人事管理条例》及相关法律法规，确保处理决定的合法性、合规性。
2. 公平公正：处理过程应公开透明，平等对待所有涉事人员，避免偏袒或歧视。
3. 事实清楚：对相关事实进行充分调查核实，确保证据确凿，避免误判或错判。

二、常见情况及具体处理方式

1. 主观故意型不在岗

   • 情况描述：未经批准擅自离岗，如长期旷工、挂名吃空饷等。
   • 处理方式：
     • 限期返岗：单位应下达《限期到岗通知书》，要求员工在规定时间内返回工作岗位。
     • 解除聘用：若员工逾期未归，且符合《事业单位人事管理条例》中规定的解除聘用合同条件（如连续旷工超过15个工作日，或1年内累计旷工超过30个工作日），单位可以解除聘用合同。
     • 追缴违规所得：若员工存在虚报冒领工资等违规行为，单位应追缴其违规所得，并可能移交司法机关处理。

2. 客观被动型不在岗

   • 情况描述：因单位安排或历史遗留问题导致的不在岗，如借调未归、停薪留职超期等。
   • 处理方式：
     • 借调清理：对于借调未归的员工，单位应要求原单位召回，或重新办理借调审批手续，明确借调期限。
     • 协商调整：对于停薪留职超期的员工，单位应与其协商调整岗位或办理退休、辞职手续。
     • 特殊情况处理：若员工因重病、家庭重大变故等特殊情况导致不在岗，单位应给予一定的理解和帮扶，暂缓处理或提供必要的支持。

三、处理步骤

1. 调查核实：单位应全面调查员工不在岗的情况，包括离岗时长、原因等，获取准确信息。
2. 听取申辩：在作出处理决定前，单位应给予员工申辩机会，充分听取其意见和解释。
3. 作出处理决定：根据调查结果和申辩情况，单位应依法作出处理决定，明确处分种类和执行期限。
4. 送达处理决定：单位应以书面形式将处理决定送达员工，并保留送达凭证。
5. 执行处理决定：员工应按照处理决定执行，如有异议可通过合法途径提出申诉。

四、处分种类

根据《事业单位人事管理条例》及相关规定，处分种类包括警告、记过、降低岗位等级或者撤职、开除等。具体处分种类应根据员工不在岗的事实清楚程度、证据确凿性及处理恰当性来决定。

五、注意事项

1. 程序合规性：单位在处理员工不在岗问题时，应确保调查取证、告知听证、决定送达等环节符合法律规定，避免程序违法导致处理决定无效。
2. 人性化处理：在处理过程中，单位应关注员工的合法权益和实际情况，对于因特殊情况导致不在岗的员工，应给予一定的理解和帮扶。
3. 信息公开与监督：单位应定期公示处理结果，接受社会监督，确保处理过程的公正性和透明度。

举例说明：某事业单位员工未经批准擅自离岗长达一个月，单位在调查核实后，依据《事业单位人事管理条例》的相关规定，给予该员工记过处分，并限期返岗。若该员工逾期未归，单位将进一步解除其聘用合同。

总结建议：事业单位在职在编的工作人员值班不在岗是一个复杂的问题，需要单位根据具体情况及法律法规来综合判断和处理。在处理过程中，单位应坚持依法依规、公平公正、事实清楚的原则，确保处理决定的合法性和有效性。同时，单位也应关注员工的合法权益和实际情况，给予必要的理解和帮扶。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。