结论：针对您购买的新电动车存在瑕疵且已付款但商家拒绝退货的情况，您可以根据瑕疵的严重程度、购车合同的具体条款以及相关法律法规来维护自己的合法权益。以下是从不同角度为您提供的详细分析和建议。
一、从瑕疵严重程度角度分析
严重瑕疵：
- 如果电动车的瑕疵严重影响了其正常使用，甚至存在安全隐患，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，您有权要求商家承担退货、更换、修理等责任。
- 在此情况下，建议您首先与商家协商，明确指出瑕疵的严重性，并要求商家按照法律规定履行退货义务。如果商家拒绝，您可以考虑向消费者协会投诉或向法院提起诉讼。
一般瑕疵：
- 如果电动车的瑕疵不影响其正常使用，或者只是轻微的不符合约定，商家可能拒绝退货，但应承担修理等责任。
- 在此情况下，您可以要求商家对电动车进行修理，并确保修理后的电动车符合质量要求。如果商家拒绝修理或修理后仍不符合要求，您也可以考虑采取法律手段维护自己的权益。
二、从购车合同角度分析
合同中有明确约定：
- 如果购车合同中明确约定了电动车的质量标准、退货条件等条款，且商家违反了这些条款，您有权根据合同约定要求商家退货。
- 在此情况下，建议您仔细审查购车合同，找出商家违反的条款，并据此与商家协商或采取法律手段。
合同中没有明确约定：
- 如果购车合同中没有明确约定电动车的质量标准或退货条件，您可以根据《中华人民共和国民法典》中关于买卖合同的一般规定来维护自己的权益。
- 在此情况下，您需要证明电动车存在瑕疵，并且该瑕疵影响了您的正常使用或构成了违约行为，从而要求商家承担相应的责任。
三、从法律程序角度分析
协商和解：
- 在采取法律手段之前，建议您首先尝试与商家协商和解。通过友好沟通，您可能能够更快地解决问题，避免不必要的法律纠纷。
投诉举报：
- 如果协商无果，您可以向当地的消费者协会或市场监管部门投诉举报商家的违法行为。这些机构会对您的情况进行调查，并可能对商家进行处罚或调解纠纷。
提起诉讼：
- 如果投诉举报也无法解决问题，您可以考虑向法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明电动车存在瑕疵以及商家的违约行为，以便法院作出公正的判决。
建议与行动：
- 收集证据：无论采取哪种方式维护自己的权益，都需要收集充分的证据来证明电动车存在瑕疵以及商家的违约行为。这些证据可以包括购车合同、发票、照片、视频、检测报告等。
- 咨询专业意见：在采取法律手段之前，建议您咨询专业律师的意见，以便更好地了解自己的权益和可能的法律后果。
- 保持冷静与理性：在处理纠纷时，请保持冷静与理性，避免采取过激行为或言语攻击商家。通过合法途径维护自己的权益才是最有效的方式。
如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。