结论前置：总公司中标后，在符合法律法规、合同约定及具备相应条件的情况下，可以设立分公司来实施项目，这一行为是合法的。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律地位与责任承担
根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，分公司是总公司的分支机构，不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。这意味着，即使分公司实际参与项目的实施，从法律角度来看，项目的责任主体仍然是总公司。因此，总公司中标后设立分公司来实施项目，在法律地位上是可行的。
二、合法合规的条件
合同约定：首先，需要审查招投标文件及最终签订的合同，确认是否包含禁止总公司交由分公司实施项目的条款。若无明确禁止，且合同中未对项目实施主体有特定要求，那么总公司设立分公司来实施项目是符合合同约定的。
招标人同意：尽管合同可能未明确禁止分公司实施项目，但为了确保项目的顺利进行和避免潜在的法律纠纷，建议总公司及时向招标人发出书面通知，详细说明由分公司实施项目的原因、分公司的资质和能力等情况，并争取获得招标人的书面同意。
分公司设立与登记：根据《中华人民共和国公司法》的规定，公司设立分公司需向公司登记机关申请登记，领取营业执照。确保分公司已依法设立并具备合法的经营资格，是实施项目的前提条件。
资质与能力匹配：分公司需具备实施项目所需的技术、人员、设备等条件和能力，以确保项目能够按照合同要求的质量、进度等标准顺利完成。总公司应对分公司的能力进行全面评估，并提供必要的支持和指导。
三、实际操作要点
明确责任划分：虽然分公司的民事责任由总公司承担，但在内部管理中，总公司与分公司应明确项目实施过程中的权利义务和责任划分。这有助于确保项目实施过程中责任落实到位，同时对外展现总公司的整体责任和担当。
加强监督与指导：总公司应对分公司的项目实施过程进行必要的监督和指导，确保分公司严格遵守相关法律法规和合同约定，避免因管理不善而引发的法律风险。
合同变更与解除：如遇特殊情况需变更合同内容或解除合同的，总公司应及时与招标人协商并取得一致意见。在变更或解除合同的过程中，应遵守相关法律法规的规定，并确保双方的合法权益得到妥善保护。
四、潜在法律风险与应对
法律风险：如果分公司不具备实施项目的能力或资质，或者总公司未对分公司进行充分的监督和指导，可能导致项目无法按时按质完成，从而引发法律纠纷和赔偿责任。
应对措施：为了降低法律风险，总公司应加强对分公司的管理和监督，确保分公司具备实施项目的能力和资质；同时，在项目实施过程中，总公司应定期与分公司进行沟通，了解项目进展情况，及时解决可能出现的问题。
总结与建议：总公司中标后设立分公司来实施项目是合法的，但需满足一定的条件和要求。为了确保项目的顺利进行和避免潜在的法律纠纷，建议总公司在设立分公司前进行充分的评估和规划，明确责任划分和加强监督与指导。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。