针对违反了未经消防验收投入使用和未经未竣工验收投入使用是合并处罚还是择重处罚的问题，结论如下：

1. 一般情况下，若两行为独立且均违法，可能面临合并处罚：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国消防法》和《中华人民共和国建筑法》的相关规定，未经消防验收合格投入使用和未经竣工验收合格投入使用，均属于违法行为。若这两个行为是独立的，且都违反了相应的法律规定，那么理论上，行政机关可以对这两个违法行为分别进行处罚，即合并处罚。
   • 实际案例：在实际操作中，如果建设单位既未进行消防验收也未进行竣工验收就擅自投入使用，行政机关可能会根据两部法律的相关规定，分别对消防验收和竣工验收的违法行为进行处罚，如罚款、责令停产停业等。

2. 若两行为存在关联或重叠，可能择重处罚或按一个行为处理：

   • 行为关联性：如果未经消防验收投入使用和未经竣工验收投入使用这两个行为在事实上存在紧密的关联，或者其中一个行为是另一个行为的必然结果，那么行政机关在处罚时可能会考虑这种关联性，避免对同一事实进行重复评价。
   • 择重处罚原则：在存在关联或重叠的情况下，行政机关可能会根据违法行为的性质、情节以及社会危害程度，选择对更严重的违法行为进行处罚，或者将两个行为视为一个整体进行处罚。
   • 实际处理：具体如何处理，还需要根据行政机关的裁量权以及相关法律法规的具体规定来确定。例如，如果竣工验收中已经包含了消防验收的内容，且行政机关认为未经竣工验收投入使用已经涵盖了未经消防验收投入使用的违法行为，那么可能会只对未经竣工验收投入使用的行为进行处罚。

法律建议：

• 合规操作：建设单位应严格按照法律法规的规定，在完成消防验收和竣工验收后，再投入使用，以避免不必要的法律风险。
• 及时整改：如果已经存在未经消防验收或未经竣工验收投入使用的情况，建设单位应立即停止使用，并尽快完成相关验收工作，以减轻可能的法律后果。
• 咨询专业：在处理此类问题时，建议建设单位咨询专业的法律人士或相关行政机关，以获取更准确、更具体的法律意见和指导。

可能法律后果：

• 行政处罚：如前所述，未经消防验收或未经竣工验收投入使用，都可能面临行政机关的罚款、责令停产停业等行政处罚。
• 民事责任：如果因未经验收投入使用导致发生安全事故或造成他人损害，建设单位还可能承担相应的民事赔偿责任。
• 刑事责任：在极端情况下，如果未经验收投入使用的行为构成犯罪（如重大责任事故罪等），建设单位的相关责任人员还可能面临刑事责任的追究。