作为律师，在代理刑事立案撤销申请案件时，需要遵循严格的法律程序，并依据案件的具体情况和所处阶段来操作。以下是我为您详细梳理的代理流程和相关要点：
一、明确撤案条件
首先，需要明确哪些情况下可以申请撤销刑事立案。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，主要包括以下几种情形：
情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪：当案件事实不符合犯罪构成要件，或即使构成犯罪但情节极其轻微，社会危害性极小时，可申请撤案。
犯罪已过追诉时效期限：如果犯罪行为发生的时间距离现在已超过法律规定的追诉时效期限，且无法定追诉时效延长或中断事由，可申请撤案。
经特赦令免除刑罚：当国家发布特赦令，对特定范围内的犯罪分子免除刑罚时，对于符合特赦条件的刑事案件，可申请撤案。
依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉：对于某些特定的亲告罪（如侮辱罪、诽谤罪等），如果没有被害人或其法定代理人的告诉，或者告诉后又撤回的，可申请撤案。
犯罪嫌疑人、被告人死亡：在侦查或审查起诉阶段，如果犯罪嫌疑人或被告人死亡，可申请撤案。
其他法律规定免予追究刑事责任的情形：如证据不足无法定罪等，也需根据具体情况判断是否可申请撤案。
二、准备撤案申请材料
在明确撤案条件后，需要准备以下撤案申请材料：
撤案申请书：详细阐述撤案的具体事由和理由，包括案件背景、事实经过、法律依据等，并由申请人签字及注明日期。
相关证据材料：如证人证言、书证、物证、和解协议等，以证明撤案理由的成立。这些证据材料应真实、合法、有效，并能够充分支持撤案申请。
三、提交撤案申请
根据案件所处的司法阶段，向相应的司法机关提交撤案申请：
侦查阶段：向立案侦查的公安机关提出申请，说明撤案意愿及理由，并提交撤案申请书和相关证据材料。
审查起诉阶段：若案件已移送检察机关，则向检察机关提交撤案申请。此时，需要与检察机关沟通，说明撤案的法律依据和事实依据，并争取检察机关的支持。
自诉案件：对于自诉案件，直接向受理案件的人民法院提交撤案申请及相关材料。在提交前，应与自诉人进行充分沟通，确保撤案申请得到自诉人的理解和支持。
四、司法机关审查与决定
司法机关在收到撤案申请后，会进行形式审查和实质审查：
形式审查：检查申请书格式、材料完整性等是否符合要求。
实质审查：评估撤案事由和证据的合理性、合法性。司法机关会综合考虑案件事实、法律依据以及社会影响等因素，作出是否批准撤案的决定。
五、后续事项处理
如果撤案申请被批准，需要处理以下后续事项：
解除强制措施：如犯罪嫌疑人被取保候审、监视居住或逮捕等，应及时解除强制措施，并退还保证金或解除保证人责任。
通知相关单位和个人：将撤案决定通知原批准逮捕的人民检察院（如涉及）、被害人及其法定代理人等相关单位和个人。
归档整理：将全部案卷材料加以整理，装订归档，以备后续查阅和参考。
六、专业咨询与策略制定
在代理刑事立案撤销申请案件时，建议咨询专业律师或法律专家，以确保撤案申请的合理性和有效性。律师可以根据案件的具体情况，制定合适的代理策略，并与司法机关进行充分沟通，争取最佳的处理结果。
综上所述，代理刑事立案撤销申请案件需要遵循严格的法律程序，并依据案件的具体情况和所处阶段来操作。作为律师，应充分准备撤案申请材料，积极与司法机关沟通，并妥善处理后续事项，以维护当事人的合法权益。