是的，三方协议通常需要盖了章之后才能正式提交和生效。以下是对这一问题的详细解析：
一、三方协议盖章的必要性
三方协议，作为明确毕业生、用人单位及学校三方在毕业生就业过程中各自权利和义务的重要书面文件，其法律效力依赖于所有相关方的盖章或签字确认。具体来说：
用人单位公章：这是三方协议中最关键的印章，代表着用人单位对协议条款的全面认可，并承诺按照约定接收毕业生入职，同时承担相应的责任和义务。没有用人单位的公章，协议对用人单位就没有约束力。
学校就业指导中心章：学校通过盖章表明已知晓并同意毕业生与用人单位的就业意向，同时承担管理和服务职责，如办理就业派遣手续等。没有学校的盖章，协议可能无法得到学校的认可和支持。
毕业生签字：虽然毕业生签字不是盖章，但同样是协议生效的必要条件。毕业生本人需在协议上签字，以表明其同意协议内容，并承诺遵守相关约定。
二、盖章的顺序和流程
在签订三方协议时，通常的流程是：
毕业生与用人单位就协议条款进行协商，达成一致后，由用人单位在协议上加盖公章。
毕业生本人在协议上签字确认。
将协议提交给学校就业指导中心，由学校审核并加盖就业指导中心章。
只有所有相关方都盖章或签字确认后，协议才正式生效。因此，在提交协议之前，必须确保所有必要的印章都已经加盖完毕。
三、特殊情况下的盖章要求
在某些特殊情况下，三方协议可能还需要加盖其他印章，如用人单位上级主管部门的章。这主要适用于国有企业、事业单位、机关单位等具有上级主管部门的组织。上级主管部门盖章起到审批和监督作用，确保招聘行为符合单位整体规划和政策要求。
四、法律后果和风险提示
如果三方协议没有盖齐所有必要的印章就提交，可能会导致以下法律后果和风险：
协议无效：没有盖齐所有必要印章的协议可能被视为无效协议，无法对各方产生法律约束力。
权益受损：如果协议无效，毕业生的就业权益可能无法得到保障，用人单位也可能面临无法招聘到合适人才的风险。
纠纷风险：未盖齐印章的协议可能引发各方之间的纠纷和争议，增加解决纠纷的成本和时间。
因此，在签订三方协议时，务必确保所有必要的印章都已经加盖完毕，以保障协议的合法性和有效性。如果你在签订三方协议过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。