劳动监察部门发现公司通过私人账户发放工资，可能采取以下措施，具体后果需结合实际情况判断：

1. 要求公司限期整改
   劳动监察部门会首先要求公司停止通过私人账户发放工资的行为，并限期通过公司对公账户重新发放工资、补缴社保及公积金（若存在漏缴情况）。若公司配合整改，通常不会进一步处罚，但需承担补缴费用及可能产生的滞纳金。

2. 行政处罚（若拒不整改或情节严重）
   根据《劳动保障监察条例》第三十条，若公司存在“以实物、有价证券等形式代替货币支付工资”或“未按规定制作工资支付台账”等违法行为，劳动监察部门可责令改正，并处以2000元以上2万元以下罚款。若通过私人账户发放工资被认定为“逃避劳动监管”，可能面临更高处罚。

3. 税务风险（关联问题）
   若公司通过私人账户发放工资未依法代扣代缴个人所得税，税务机关可能依据《税收征收管理法》第六十九条，对公司处以未扣缴税款50%至3倍的罚款，并追缴税款及滞纳金。此外，若涉及虚开发票、隐瞒收入等行为，可能构成逃税罪，需承担刑事责任。

4. 劳动争议中的不利后果
   在劳动仲裁或诉讼中，若公司无法提供通过私人账户发放工资的合法证据（如劳动合同、工资条、转账记录等），可能被认定为“未及时足额支付劳动报酬”，员工可据此要求解除劳动合同并主张经济补偿金（N倍工资）。

建议：

• 公司应立即停止通过私人账户发放工资的行为，规范使用对公账户，并完善工资支付台账、社保缴纳记录等证据。
  
• 若已因私人账户发薪被调查，应积极配合劳动监察部门，主动整改并补缴费用，以降低处罚风险。
  
• 员工若发现公司通过私人账户发薪，可向劳动监察部门投诉（12333热线），或通过劳动仲裁主张权益。
  

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