就业协议公司已经盖章的情况下，公司联系人一般是可以由公司自行填写的，但需确保填写内容的真实性和合法性，且最好是在双方协商一致的基础上进行。以下从不同角度为你详细分析：

法律角度

从法律层面来看，就业协议是用人单位与劳动者之间就建立劳动关系而达成的初步意向协议，它具有一定的法律效力。公司作为用人单位，在就业协议上盖章，意味着公司认可了协议中的各项条款和内容。而公司联系人作为公司的一个代表或信息点，其填写通常属于公司内部事务，只要填写的联系人信息真实有效，且能够代表公司进行相关事务的沟通和联系，那么公司自行填写联系人信息并不违反法律规定。

实际操作角度

在实际操作中，就业协议的签订往往涉及多个环节和多方协商。公司盖章后填写联系人信息，可能是为了后续与劳动者进行更顺畅的沟通或办理相关手续。这种情况下，只要公司填写的联系人信息准确无误，且劳动者对此没有异议，那么这种填写方式是可行的。然而，如果劳动者对填写的联系人信息有疑问或要求更改，那么双方应该进行协商，并在协商一致的基础上进行修改。

潜在风险与建议

1. 信息真实性风险：如果公司填写的联系人信息不真实或无法联系，可能会导致劳动者在后续沟通或办理手续时遇到困难。因此，公司在填写联系人信息时，应确保信息的真实性和有效性。
2. 协商一致原则：尽管公司有权自行填写联系人信息，但最好还是在与劳动者协商一致的基础上进行。这样可以避免后续因信息不一致而产生的纠纷或误解。
3. 书面确认：如果双方对联系人信息有特别的约定或要求，建议以书面形式进行确认，并作为就业协议的附件或补充条款。这样可以增强协议的完整性和法律效力。

总结来说，就业协议公司盖章后，公司联系人信息一般可以由公司自行填写，但需确保信息的真实性和合法性，并最好在与劳动者协商一致的基础上进行。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，你可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的解答和帮助。