原配在怀疑小三的孩子是老公的情况下，确实可以通过亲子鉴定来寻求确认，但这一过程需要遵循一定的法律程序和道德准则。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、法律角度
亲子鉴定的法律依据：
- 亲子鉴定在法律上通常用于确认亲子关系，其结果具有法律效力。在婚姻家庭纠纷中，如果一方对亲子关系存在疑虑，可以通过法律途径申请进行亲子鉴定。
申请亲子鉴定的条件：
- 通常，申请亲子鉴定需要得到被鉴定人的同意，尤其是当被鉴定人是成年人时。对于未成年人，一般需要其法定监护人的同意。
- 在婚姻家庭纠纷中，如果原配怀疑小三的孩子是老公的，且老公也同意进行亲子鉴定，那么可以共同向有资质的鉴定机构提出申请。
法律后果：
- 如果亲子鉴定结果显示小三的孩子确实是老公的，那么这一结果可能作为婚姻家庭纠纷中的证据，影响财产分割、抚养权归属等问题的判决。
- 如果亲子鉴定结果显示小三的孩子不是老公的，那么原配的疑虑得到消除，但也可能引发其他法律问题，如诽谤、侵犯名誉权等（如果原配在未经证实的情况下公开散布了不实言论）。
二、道德角度
尊重隐私：
- 在进行亲子鉴定之前，应充分考虑和尊重相关各方的隐私权。未经同意擅自进行亲子鉴定可能侵犯他人的隐私，引发不必要的纠纷。
家庭和谐：
- 亲子鉴定可能对家庭关系产生深远影响。在决定进行亲子鉴定之前，应谨慎考虑其对家庭和谐可能带来的破坏，并尝试通过沟通、协商等方式解决问题。
三、实际操作建议
沟通协商：
- 在怀疑小三的孩子是老公的情况下，首先尝试与老公进行坦诚的沟通，了解他的想法和态度。如果可能的话，也可以尝试与小三进行沟通，但需注意方式方法和法律风险。
寻求法律帮助：
- 如果沟通协商无果，且原配坚持要进行亲子鉴定以确认亲子关系，那么可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、协助申请亲子鉴定等法律服务。
保护自身权益：
- 在进行亲子鉴定的过程中，原配应注意保护自身的合法权益。例如，确保鉴定机构的资质和信誉、妥善保管鉴定结果等。
总结来说，原配在怀疑小三的孩子是老公的情况下，可以通过法律途径申请进行亲子鉴定以寻求确认。但这一过程需要遵循法律程序和道德准则，尊重相关各方的隐私权和合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。