针对您目前的情况，首先明确结论：若因协议还款未能履行而被起诉到法院，且农村唯一住房已抵押，该房屋确实存在被拍卖的风险，但具体是否会被拍卖需视多种情况而定。
一、关于被起诉后的法律程序
应诉准备：
- 当您收到法院的起诉状副本后，应尽快准备应诉材料，包括但不限于还款协议、还款记录（如有）、无法还款的证明材料等。
- 您可以考虑委托律师代理诉讼，以更好地维护您的合法权益。
庭审过程：
- 在庭审中，您需要向法院说明您目前的经济状况，以及无法按时还款的原因。
- 法院会根据双方提供的证据和陈述，进行事实认定和法律适用，最终作出判决。
判决结果：
- 如果法院判决您需要还款，而您仍未履行，债权人可以申请法院强制执行。
二、关于农村唯一住房抵押后的拍卖问题
抵押权的实现：
- 根据《民法典》的相关规定，抵押权人在债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形时，有权依法以该抵押财产折价或者以拍卖、变卖该抵押财产所得的价款优先受偿。
- 因此，如果您的农村唯一住房已抵押给债权人，且您未能履行还款义务，债权人有权申请法院拍卖该房屋以实现其抵押权。
拍卖的例外情况：
- 生活必需住房保护：虽然法律允许拍卖抵押房产，但在实际操作中，法院会考虑债务人的基本生活需求。如果拍卖该房屋将导致您无家可归，法院可能会暂缓拍卖或采取其他措施。
- 执行和解或调解：在执行过程中，您可以与债权人协商达成和解或调解协议，通过分期还款、延期还款等方式解决债务问题，从而避免房屋被拍卖。
- 其他财产可供执行：如果您有其他财产可供执行，法院可能会优先执行其他财产，以保留您的住房。
拍卖程序：
- 如果法院决定拍卖您的房屋，会依法进行评估、拍卖等程序。
- 拍卖所得款项将优先用于偿还债权人的债务，剩余部分（如有）将退还给您。
三、建议与措施
积极沟通：
- 与债权人保持积极沟通，说明您的经济状况和还款意愿，尝试达成和解或调解协议。
寻求法律援助：
- 咨询专业律师（如我），了解您的法律权益和可能的救济途径。
- 律师可以帮助您制定应诉策略、准备应诉材料，并在庭审中为您辩护。
考虑其他还款方式：
- 如果可能，尝试通过其他方式筹集资金还款，如向亲友借款、出售其他财产等。
关注执行进展：
- 如果案件已进入执行阶段，密切关注执行进展，及时与法院沟通您的情况和诉求。
最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，因此上述分析仅供参考。 如果您面临类似问题，建议直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更准确的法律建议。