结论：“限制人身自由的处罚由法律保存”这一表述，实际上是指限制人身自由的处罚只能由法律来设定，这是为了保护公民的基本权利和自由，确保处罚的合法性和正当性。

详细分析如下：

1. 法律依据与设定权限：

   • 依据《中华人民共和国立法法》和《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，限制人身自由的处罚是最为严厉的行政措施之一，它直接涉及公民的人身自由这一基本权利。
   • 因此，其设定权被严格限定于法律层面，即由全国人民代表大会及其常务委员会制定的规范性文件。这一规定确保了限制人身自由处罚的设定具有最高的权威性、严肃性和审慎性，避免了其他规范性文件随意创设此类处罚，从而有效保障公民的人身自由权利不受侵犯。

2. 行使权力的主体：

   • 根据《中华人民共和国行政处罚法》的明确规定，限制人身自由的行政处罚权只能由公安机关行使。这意味着，无论是决定权还是执行权，都严格限于公安机关的范围之内。
   • 其他任何机关、组织或个人均无权行使这一权力。此规定确保了限制人身自由处罚的行使主体具有明确的法定性和专业性，有助于维护社会秩序和公民的合法权益。

3. 法律后果与公民权益：

   • 非法限制他人人身自由是违法行为，严重的可能构成犯罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法拘禁他人或者以其他方法非法剥夺他人人身自由的，将受到相应的刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、管制等。
   • 公民的人身自由受法律保护，任何非法限制公民人身自由的行为都是违法的。如果公民遭遇此类情况，应尽快报警并寻求法律援助，以维护自己的合法权益。

4. 实际案例与法律应用：

   • 在实际生活中，非法限制人身自由的行为可能涉及多种情形，如非法拘禁、绑架、扣押等。这些行为不仅违反了法律法规，也严重侵犯了公民的人身自由和尊严。
   • 在处理此类案件时，司法机关会严格依据法律法规进行审判和处罚，确保处罚的公正性和合法性。同时，公民也应增强法律意识，了解自身权利，遇到非法限制人身自由的情况时，能够迅速采取有效措施保护自己的合法权益。

总结与建议：

• 限制人身自由的处罚只能由法律来设定，且其行使权严格限定在公安机关范围内。这一规定旨在保护公民的基本权利和自由，确保处罚的合法性和正当性。
• 公民应增强法律意识，了解自身权利，遇到非法限制人身自由的情况时，及时报警并寻求法律援助。
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