在政府采购质疑期间，原则上并不自动暂停签订合同，但特定情形下可以暂停。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般原则：质疑期间不自动暂停签订合同
在政府采购活动中，供应商对采购文件、采购过程或中标、成交结果提出质疑，是法律赋予的权利。然而，质疑的提出并不直接导致采购活动的暂停或合同的签订被搁置。根据《中华人民共和国政府采购法》及相关规定，除非存在特定情形，否则采购人或采购代理机构在质疑期间仍可继续推进采购活动，包括与中标、成交供应商签订合同。
二、特定情形下可以暂停签订合同
尽管质疑期间不自动暂停签订合同，但在以下特定情形下，采购人或采购代理机构应当暂停签订合同：
质疑事项可能影响中标、成交结果：如果供应商提出的质疑事项直接关系到中标、成交结果的合法性或公正性，且该质疑事项有可能导致中标、成交结果被撤销或变更，那么采购人或采购代理机构应当暂停签订合同，以避免因签订合同而可能产生的法律纠纷和经济损失。
采购人或采购代理机构认为需要暂停：除了上述法定情形外，采购人或采购代理机构在认为有必要暂停签订合同的情况下，也可以自行决定暂停。这通常发生在质疑事项较为复杂、需要进一步调查核实，或者质疑事项可能对采购活动产生重大影响时。
财政部门通知暂停采购活动：如果财政部门在处理投诉过程中，认为需要暂停采购活动的，可以通知采购人或采购代理机构暂停签订合同。这是财政部门对政府采购活动进行监督和管理的一种手段，旨在确保采购活动的合法性和公正性。
三、暂停签订合同的期限与后果
暂停期限：暂停签订合同的期限通常与质疑或投诉的处理期限相关联。在质疑或投诉处理期间，采购人或采购代理机构应当暂停签订合同，直至质疑或投诉处理完毕并作出决定。
法律后果：如果采购人或采购代理机构在质疑期间未经法定程序擅自签订合同，且该合同因质疑事项被撤销或变更，那么采购人或采购代理机构可能需要承担相应的法律责任，包括赔偿因擅自签订合同而给供应商造成的损失等。
四、实际操作建议
及时沟通：在质疑期间，供应商应与采购人或采购代理机构保持及时沟通，了解质疑处理进展和合同签订情况。
依法维权：如果供应商认为采购人或采购代理机构在质疑期间擅自签订合同侵犯了其合法权益，可以依法向财政部门投诉或寻求其他法律救济途径。
谨慎决策：采购人或采购代理机构在质疑期间应谨慎决策是否签订合同，充分考虑质疑事项的可能影响和法律后果。
如果您在政府采购活动中遇到相关问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。