结论：劳动仲裁未列一人有限公司股东为被申请人，在起诉时能否将其作为被告，需视具体情况而定。一般情况下，劳动仲裁的被告是用人单位，但在特定情形下，股东可能需承担连带责任，从而在诉讼中成为被告。
详细分析：
一般情况下的劳动关系相对性：
- 根据劳动关系的相对性原则，劳动争议通常发生在劳动者与用人单位之间。因此，在劳动仲裁阶段，被告通常是用人单位，而非其股东。股东作为公司的投资者，享有有限责任的保护，即他们仅以其出资额为限对公司承担责任。
一人有限责任公司的特殊情况：
- 对于一人有限责任公司，如果股东不能证明公司财产独立于自己的财产，根据《公司法》的相关规定，股东可能需要对公司债务承担连带责任。这意味着，在劳动仲裁中，虽然直接被告是公司，但如果劳动者能证明股东与公司财产混同，那么在后续的诉讼程序中，股东可能因承担连带责任而成为被告。
股东存在违法行为的情形：
- 如果股东存在未依法履行出资义务、抽逃出资等违法行为，导致公司无法承担对劳动者的赔偿责任，劳动者可以在仲裁裁决生效后，通过执行程序申请追加该股东为被执行人，要求其在未出资本息范围内对公司债务不能清偿的部分承担补充赔偿责任。在这种情况下，股东虽然不是劳动仲裁的直接被告，但在后续的诉讼或执行程序中，可能因承担法律责任而成为相关程序的当事人。
法律建议：
- 如果您认为一人有限责任公司的股东与公司财产混同，或者股东存在未依法履行出资义务、抽逃出资等违法行为，导致公司无法承担劳动赔偿责任，建议您在劳动仲裁后，及时通过诉讼程序主张股东的连带责任或补充赔偿责任。
- 在提起诉讼前，建议您收集充分的证据，如公司财务记录、股东出资证明、抽逃出资的证据等，以证明股东存在违法行为或与公司财产混同的情况。
- 如果您对具体操作流程或法律条款有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律指导和建议。
可能法律后果：
- 如果股东被证明存在违法行为或与公司财产混同，可能面临承担连带责任或补充赔偿责任的法律后果，这将对其个人财产产生直接影响。
- 如果劳动者未能提供充分证据证明股东存在违法行为或与公司财产混同，可能面临无法追究股东法律责任的风险。因此，在提起诉讼前，务必确保收集到充分的证据。