机关事业单位女职工在产假期间，其绩效工资的发放需根据具体情况来判断，总体原则为基础性绩效工资应正常发放，奖励性绩效工资的发放需结合单位薪酬制度和绩效评定办法来确定。以下是对这一问题的详细分析：
一、基础性绩效工资的正常发放
根据国家对女职工的特殊保护和照顾政策，以及《女职工劳动保护特别规定》的精神，女职工在产假期间的基础性绩效工资应当正常发放。这是为了保障女职工产假期间的基本收入，确保其生活不受影响。基础性绩效工资是女职工工资的重要组成部分，单位不得因其休产假而扣减。
二、奖励性绩效工资的灵活处理
奖励性绩效工资的发放则取决于用人单位的绩效工资分配办法和绩效评定标准。具体来说：
如果单位的绩效工资评定方案明确规定，绩效工资严格按照实际出勤情况以及实际完成工作任务情况来核算，且该方案经过民主程序制定并已向员工公示，那么女职工在产假期间由于未实际出勤工作，可能会影响部分与出勤、工作成果直接挂钩的奖励性绩效部分。但单位在扣减时，应确保扣减的合理性和适度性，避免过度损害女职工的合法权益。
对于已经参加生育保险的女职工，其产假期间的生育津贴由生育保险基金支付，支付标准为本企业上年度职工月平均工资。在这种情况下，单位无需再额外支付奖励性绩效工资，但也不能因此扣减女职工原本应得的奖励性绩效工资部分（如果单位薪酬制度中有明确规定且该规定合法合理）。
若用人单位未参加生育保险，则需要按照女职工产假前的工资标准来支付生育津贴。这种情况下，女职工产假期间的收入将与其产假前的工资水平保持一致，包括基础性绩效工资和奖励性绩效工资（如适用）。单位应确保按照这一标准支付，不得随意扣减。
三、争议解决途径
如果女职工认为单位在产假期间不合理地扣减了绩效工资，可以通过以下途径维护自己的合法权益：
沟通协商：首先与单位进行沟通协商，要求单位说明扣减依据。通过友好协商，往往能够达成双方都能接受的解决方案。
投诉或仲裁：若协商不成，女职工可以向当地劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁。在投诉或仲裁过程中，女职工需要提供充分的证据来证明单位的不合理扣减行为，如工资条、绩效评定方案、考勤记录等，以便相关部门或机构能够依法作出公正裁决。
总结与建议：机关事业单位女职工在产假期间的绩效工资发放问题，需结合单位的具体薪酬制度和国家相关法律法规进行综合考虑。在保障女职工基本收入的同时，也要确保单位内部的薪酬制度的公平性和合理性。如遇争议，建议女职工首先与单位进行沟通协商，若协商不成，再通过投诉或仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。