针对您提出的“普通退休小学教师被要求上缴护照的法律依据是什么”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，国家公安部出入境管理局明确规定退休事业单位人员不做出入境限制。这意味着，在一般情况下，退休的小学教师作为普通公民，其出入境权利是不应受到限制的。
然而，您所遇到的情况可能涉及到地方性的管理规定或特定政策。根据我了解到的信息，某些地区或单位可能会根据自身的实际情况和管理需要，制定一些额外的出入境管理规定。这些规定可能针对特定人群，如干部（有职级）或特定单位的人员，要求他们在因私出国（境）时进行审批或上缴护照。
在您提到的具体案例中，石嘴山市惠农区参照上级文件制定了《关于区委管理干部因私出国（境）有关问题的通知》，其中规定“已经办理离退休手续的区委管理干部申请因私出国（境），由本人所在单位党委（党组）严格程序、从严审批。各乡镇、街道，区直各部门管理的干部因私出国（境）的审批，参照本通知执行”。这一规定可能是导致您被要求上缴护照的直接原因。
但需要强调的是，这一规定是针对“区委管理干部”的，而普通退休小学教师通常并不属于这一范畴。因此，如果惠农区教育局或组织部要求所有退休教师都上缴护照，这可能存在对政策的误解或过度执行的情况。
法律依据方面：
《中华人民共和国护照法》：该法规定了护照的申请、签发和管理等事项，但并未明确规定退休人员需要上缴护照。相反，它保障了公民出入国境的权益，并禁止任何组织或个人非法扣押护照。
地方性管理规定：如上述提到的石嘴山市惠农区的相关通知，这些规定可能基于地方实际情况和管理需要而制定，但应确保不违反国家法律法规和公民的基本权利。
建议：
与相关部门沟通：您可以与惠农区教育局或组织部进行沟通，了解他们要求上缴护照的具体依据和目的，并表达您的疑虑和诉求。
咨询法律专业人士：如果您认为自己的权益受到了侵害，可以咨询法律专业人士，了解您的法律权利和可能的维权途径。
关注政策变化：由于政策可能会随着时间和实际情况的变化而调整，您可以关注相关政策的最新动态，以便及时了解自己的权利和义务。
综上所述，普通退休小学教师被要求上缴护照的法律依据并不明确，且可能存在对政策的误解或过度执行的情况。建议您与相关部门进行沟通，并咨询法律专业人士以维护自己的合法权益。