公司扣留电脑是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
隐私权角度
个人使用与隐私保护：
- 如果电脑是公司分配给员工个人使用，且公司知晓电脑中可能含有员工的私人信息，那么未经员工同意擅自扣留电脑并查看或恢复其中的文件，很可能侵犯了员工的隐私权。隐私权是每个人的基本权利，受到法律的保护，任何组织或个人都不得非法侵犯。
合理怀疑与程序遵循：
- 若公司有合理理由怀疑员工利用公司电脑从事损害公司利益的行为，如泄露商业机密、进行非法交易等，并在遵循一定程序（如提前告知员工、在必要范围内进行检查）的情况下扣留电脑并恢复文件，其行为的合法性会相对复杂。但即便如此，公司也应确保在合法、合理的范围内行使权利，避免过度侵犯员工的隐私权。
财产权角度
电脑所有权与管理权：
- 电脑若属于公司财物，公司有权基于所有权进行管理。然而，这并不意味着公司可以随意侵犯员工在电脑中的私人权益。如果电脑内存储的私人文件具有财产价值，如个人创作的商业价值作品，公司不当扣留导致文件被获取或损坏，可能构成对财产权的侵害。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，员工对其私人物品享有合法的所有权和控制权。公司未经同意擅自扣留电脑并恢复文件，属于侵权行为，员工有权要求公司停止侵害、排除妨碍、消除危险，并可能要求公司承担侵权责任。
公司规定角度
规章制度的重要性：
- 若公司此前有明确规定禁止在公司电脑存储私人信息，员工在一定程度上违反了公司规定。但即便如此，公司也不能直接采取扣留电脑恢复文件这种可能侵犯员工合法权益的方式来处理。公司应按照规定的合法程序进行处理，如先与员工沟通、要求员工自行删除私人信息等。
合法性与合理性平衡：
- 公司在制定和执行相关规定时，应确保不过度侵犯员工的合法权益。公司应在合理范围内行使权利，平衡好公司利益与员工权益之间的关系。
维权途径与建议
- 沟通协商：员工应先尝试与公司进行沟通协商，要求公司停止侵权行为并赔偿损失。在沟通过程中，员工可以明确表达自己的权益和诉求，并寻求双方都能接受的解决方案。
- 法律途径：若协商不成，员工可以考虑向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或者提起民事诉讼等法律途径来维护自己的权益。在采取法律途径前，员工应收集好相关证据，如电脑扣留的记录、文件恢复的记录等，以便在法律程序中证明自己的权益受到了侵害。
总结来说，公司扣留电脑是否合法取决于多种因素，包括隐私权、财产权以及公司规定等。员工在面对此类情况时，应了解自己的合法权益，并采取适当的措施进行维权。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。