结论：未竣工但有备案验收的房产是否可以运营及是否合法，需根据具体情况判断，一般情况下，未竣工的房产即使有备案验收，也不应直接投入运营，否则可能面临法律风险。以下从不同角度详细分析：
一、从竣工验收的法定要求角度
根据相关法律法规，建设工程竣工验收是确保工程质量、安全等符合规定标准的重要环节。只有经过完整的竣工验收程序，并取得竣工验收合格证明后，工程才具备交付使用的条件。如果房产尚未竣工，即便有部分备案验收（如某些分项工程的验收备案），这并不等同于整体工程的竣工验收合格。在这种情况下，将未竣工的房产投入运营，可能违反了关于建设工程竣工验收的强制性规定，面临行政处罚等法律风险。
二、从合同约定的角度
如果房产的建设、使用等涉及相关合同（如建设工程施工合同、租赁合同等），那么合同中通常会明确约定房产的交付条件、使用时间等关键条款。若合同中明确规定房产需经竣工验收合格后方可交付使用或运营，而实际中房产未竣工即投入运营，这将构成违约行为，违约方需承担相应的违约责任，如赔偿损失、支付违约金等。
三、从实际运营的风险角度
即使房产有部分备案验收，但未竣工意味着可能还存在一些未完成的建设工程或未解决的质量问题。将这些存在潜在风险的房产投入运营，不仅可能对运营者的自身利益造成损害（如因工程质量问题导致的维修费用、停业损失等），还可能对使用房产的第三方（如租户、顾客等）的人身安全和财产安全构成威胁。一旦发生安全事故，运营者将面临严重的法律责任，包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
四、特殊情况说明
当然，也存在一些特殊情况。例如，某些临时性的运营活动（如临时展览、促销活动等），可能在符合一定条件下（如取得相关部门的临时许可、确保安全等）可以在未竣工的房产内进行。但这种情况需要严格遵守相关法律法规和部门规章的规定，并履行相应的审批手续。
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