结论：没有结婚证但有三个孩子的情况下，双方并非法律上的夫妻关系，可以分开，但这并不免除双方对子女的抚养义务。女方有权起诉要求获得一个或多个孩子的抚养权，法院会根据子女的权益和双方的具体情况来判决。

详细分析：

1. 关于分开的问题：

   • 没有结婚证意味着双方并未在法律上建立婚姻关系，因此，从法律角度来看，双方并不构成夫妻，可以随时分开，无需经过离婚程序。
   • 但需要注意的是，尽管双方不是法律上的夫妻，对于共同生育的子女，双方仍然负有抚养、教育和保护的责任。这是基于亲子关系的法定义务，与是否结婚无关。

2. 关于抚养权的问题：

   • 女方作为孩子的母亲，有权起诉要求获得一个或多个孩子的抚养权。抚养权的归属通常取决于子女的权益和双方的具体情况。
   • 法院在判决抚养权时，会综合考虑多个因素，包括但不限于：双方的经济能力、教育背景、生活环境、与子女的感情联系、子女的年龄和性别等。
   • 如果女方能够证明自己具备更好的抚养条件，或者男方存在不利于子女成长的因素（如虐待、遗弃、严重疾病等），那么女方获得抚养权的可能性会更大。

3. 关于抚养费的支付：

   • 无论抚养权归谁所有，未直接抚养子女的一方都有义务支付抚养费。抚养费的数额通常根据子女的实际需要、双方的负担能力和当地的实际生活水平来确定。
   • 如果男方不履行支付抚养费的义务，女方可以向法院申请强制执行。

4. 实际操作建议：

   • 在决定分开并争取抚养权之前，女方应尽可能收集有利于自己的证据，如经济能力证明、教育背景证明、与子女的感情联系证明等。
   • 女方可以咨询专业律师，了解具体的法律程序和策略，以便更好地维护自己和子女的权益。
   • 在诉讼过程中，女方应保持冷静和理性，积极配合法院的调查和调解工作，争取达成对自己和子女最有利的判决结果。

后续行动建议：

• 如果你或女方正在面临这样的问题，建议尽快咨询专业律师，了解具体的法律程序和策略。
• 在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，避免情绪化的决策和行为。
• 如有需要，我可以为你提供更详细的法律咨询和帮助，请直接向我提问。