结论前置：患有癌症的员工可以主动与单位协商解除合同，这是员工的权利。不过，在协商解除合同的过程中，员工需要注意保护自己的合法权益，确保解除协议的内容合法且不损害自身利益。

一、协商解除合同的法律依据

1. 《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条：用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。这一条款为劳动者和用人单位协商解除合同提供了明确的法律依据。

二、协商解除合同的具体操作

1. 提出协商：员工可以主动向单位提出协商解除合同的意愿，说明自己的情况和原因，如癌症治疗需要、身体状况无法继续工作等。

2. 协商内容：在协商过程中，员工应与单位就解除合同的具体条款进行充分沟通，包括解除时间、经济补偿、社保缴纳等事项。员工应确保协议内容合法，不损害自己的合法权益。例如，经济补偿应按照员工在本单位的工作年限和工资水平进行计算，确保员工得到合理的补偿。

3. 签订协议：双方达成一致后，应签订书面的解除劳动合同协议，明确双方的权利和义务。协议应详细列明解除原因、解除时间、经济补偿等关键条款，以避免后续纠纷。

三、协商解除合同中的注意事项

1. 医疗期内的保护：虽然员工可以主动协商解除合同，但如果在规定的医疗期内，员工应特别注意保护自己的权益。根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定，医疗期内的员工，用人单位不得随意解除劳动合同。因此，在医疗期内协商解除合同时，员工应确保自己得到合理的经济补偿和社保缴纳等保障。

2. 保留证据：员工在协商解除合同的过程中，应保留好相关证据，如医疗证明、协商记录、解除协议等。这些证据在后续可能出现的纠纷中具有重要的证明作用。

3. 咨询专业意见：在协商解除合同前，员工可以咨询专业律师或劳动仲裁机构的意见，了解自己的权益和义务，以及协商解除合同的法律后果。这有助于员工在协商过程中更加理性地维护自己的权益。

四、特殊情况下的处理

1. 如果单位不同意协商解除：如果员工提出协商解除合同的意愿后，单位不同意解除，员工不能强行要求解除合同。此时，员工可以考虑继续履行合同或依据法律规定寻求其他解决途径，如申请劳动仲裁等。

2. 如果合同中有特殊约定：如果劳动合同中有关于协商解除合同的特殊约定，如提前通知期限、经济补偿标准等，员工在协商解除合同时应遵守这些约定。如果约定违反法律法规的强制性规定，则该约定无效。

举例说明：假设一位员工患有癌症，需要长期治疗，无法继续从事原工作。他可以向单位提出协商解除合同的意愿，并说明自己的情况和原因。在协商过程中，他与单位就解除时间、经济补偿等事项进行了充分沟通，并签订了书面的解除劳动合同协议。协议中明确列明了双方的权利和义务，确保了员工的合法权益得到保障。

最后建议：患有癌症的员工在协商解除合同时，应充分了解自己的权益和义务，确保协议内容合法且不损害自身利益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。