结论：在厂里承包的第三方物流跑了的情况下，运费承担问题需根据具体情况分析，主要取决于合同约定、物流公司的法律责任以及厂方是否已尽到合理审查义务等因素。以下从不同角度进行详细分析：

1. 合同约定角度：

   • 若合同中有明确约定：首先，应查看厂方与物流公司签订的承包合同或运输合同中，是否有关于物流公司违约或失联情况下运费承担的具体条款。如果合同中有明确约定，如“物流公司违约或无法履行运输义务时，运费由物流公司承担”，则应按照合同约定执行。
   • 若合同中无明确约定：若合同中没有相关条款，则需要根据法律规定和行业惯例来判断。

2. 物流公司法律责任角度：

   • 物流公司违约：如果物流公司因自身原因（如资金链断裂、管理不善等）导致无法继续履行运输义务，且未提前通知厂方或未采取合理措施减少损失，则物流公司构成违约。根据《民法典》中关于合同违约的规定，物流公司应承担违约责任，包括赔偿厂方因此遭受的损失，这可能包括已支付的运费、因物流中断导致的额外费用等。
   • 物流公司失联或破产：如果物流公司失联或进入破产程序，厂方作为债权人，可以向物流公司的破产管理人申报债权，要求赔偿损失。但在此情况下，厂方能否全额收回运费及损失，取决于物流公司的资产状况和破产程序的进展。

3. 厂方审查义务角度：

   • 厂方未尽审查义务：如果厂方在选择物流公司时未尽到合理的审查义务，如未核实物流公司的资质、信誉、财务状况等，导致选择了不靠谱的物流公司，那么厂方在一定程度上也可能需要承担部分责任。但这种情况下的责任划分需根据具体案情和法院的判断来确定。
   • 厂方已尽审查义务：如果厂方在选择物流公司时已尽到合理的审查义务，且物流公司失联或违约是由于不可预见、不可避免的原因导致的，那么厂方通常不需要承担运费损失的责任。

建议：

• 立即采取措施：厂方应立即与物流公司联系，尝试了解其失联或违约的具体原因，并保留相关证据（如合同、付款凭证、沟通记录等）。
• 协商解决：如果可能，厂方可以尝试与物流公司协商解决运费承担问题，如要求物流公司退还已支付的运费或赔偿损失。
• 法律途径：如果协商无果，厂方可以考虑通过法律途径解决纠纷，如向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。在此过程中，厂方应咨询专业律师的意见，以确保自身权益得到充分保护。

后续行动：

• 在未来选择物流公司时，厂方应加强对物流公司的审查和管理，确保选择有资质、信誉良好、财务状况稳定的物流公司进行合作。
• 考虑在合同中增加关于物流公司违约或失联情况下运费承担的具体条款，以明确双方的权利和义务，减少未来可能发生的纠纷。

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