核心结论：修村通公路误挖银杏树的赔偿问题，需根据银杏树的所有权归属、误挖行为性质及造成的实际损失等因素综合判断，具体赔偿方式和金额需结合实际情况确定。以下分情况详细说明：

1. 若银杏树属于村民个人所有：

   • 赔偿原则：根据《民法典》中关于侵权责任的规定，误挖他人财物（包括树木）需承担赔偿责任，赔偿范围通常包括树木本身的价值、因误挖导致的直接经济损失（如移植费用、因树木死亡导致的其他损失等）。
   • 赔偿方式：可协商确定赔偿金额，或委托专业机构对银杏树的价值进行评估，根据评估结果进行赔偿。若协商不成，可通过诉讼途径解决。

2. 若银杏树属于村集体所有：

   • 赔偿原则：同样依据《民法典》中关于侵权责任的规定，误挖村集体财物需承担赔偿责任。赔偿范围包括树木价值、因误挖导致的村集体损失（如影响村容村貌、破坏公共绿地等）。
   • 赔偿方式：由村集体与误挖方协商赔偿事宜，或通过村民会议、村民代表会议等民主议定程序确定赔偿方案。若协商无果，村集体可依法提起诉讼。

3. 若误挖行为涉及行政违法或犯罪：

   • 行政违法：若误挖行为违反了《森林法》、《公路安全保护条例》等相关法律法规，可能面临行政处罚，如罚款、责令补种树木等。此时，赔偿问题可能作为行政处罚的一部分或后续民事赔偿程序处理。
   • 犯罪：若误挖行为情节严重，构成犯罪（如故意毁坏财物罪），则需依法追究刑事责任，并同时承担民事赔偿责任。

4. 赔偿金额的确定：

   • 树木价值评估：可委托林业部门或专业评估机构对银杏树的价值进行评估，作为赔偿金额的参考依据。
   • 实际损失计算：根据误挖行为导致的实际损失（如移植费用、因树木死亡导致的其他经济损失等）进行计算。
   • 协商与调解：在赔偿金额确定过程中，鼓励双方通过协商、调解等方式达成一致，以节约诉讼成本和时间。

建议：在处理此类赔偿问题时，建议双方保持冷静，通过合法途径解决争议。若对赔偿金额或方式存在分歧，可寻求法律援助或咨询专业律师，以确保自身权益得到妥善维护。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。