针对您提出的“单位和员工协商解除劳动合同，员工有工伤该怎么赔偿”的问题，这是一个涉及工伤保险和劳动合同解除后权益保障的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

一、核心结论

协商解除劳动合同并不影响工伤职工依法获得应有的赔偿。具体赔偿项目、流程和金额需根据工伤认定情况、伤残等级以及地方规定来确定，主要包括一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金等。

二、详细分析

1. 已认定工伤且完成劳动能力鉴定的情况

• 一次性伤残补助金：

  • 无论劳动合同是否解除，只要被认定为工伤并完成劳动能力鉴定，职工均有权获得一次性伤残补助金。
  • 该补助金由工伤保险基金支付，标准根据伤残等级确定，例如七级伤残为13个月本人工资，八级为11个月，依此类推。

• 一次性工伤医疗补助金：

  • 在解除劳动合同后，工伤职工可以获得一次性工伤医疗补助金。
  • 该补助金由工伤保险基金支付，具体标准由各省、自治区、直辖市人民政府规定，通常与当地经济发展水平、职工平均工资等因素相关。

• 一次性伤残就业补助金：

  • 这是由用人单位支付的一项补助金，旨在弥补职工因工伤导致的就业损失。
  • 标准同样由地方规定，例如在某些地区，五级伤残可能为五十个月的本人工资，依此类推至十级伤残为四个月的本人工资。

2. 协商解除劳动合同时未认定工伤的情况

• 工伤认定申请时效内：

  • 如果在解除劳动合同后发现工伤且未超过申请时效（一般为事故伤害发生之日起或职业病诊断之日起1年内），职工仍可申请工伤认定。
  • 认定后，按已认定工伤的标准进行赔偿，但需注意收集证明劳动关系和工伤事实的证据。

• 超过工伤认定申请时效：

  • 若超过申请时效，职工可与原用人单位协商赔偿。
  • 协商不成时，职工可根据民事侵权法律规定向法院提起民事诉讼，但赔偿难度可能较大，且赔偿标准与工伤赔偿不同。

三、实际操作建议

1. 及时申请工伤认定和劳动能力鉴定：

   • 这是确定赔偿标准和数额的基础，也是维护自身权益的关键步骤。

2. 了解地方规定：

   • 不同地区对于一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金的标准可能有所不同，因此需要了解当地的具体规定。

3. 依法协商：

   • 在协商解除劳动合同时，双方应就赔偿问题进行充分沟通，力求达成共识。
   • 职工应明确自己的权益，不轻易放弃应得的赔偿。

4. 寻求专业法律帮助：

   • 如果对赔偿问题存在疑问或无法达成一致，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。

四、总结

协商解除劳动合同后的工伤赔偿问题涉及多个方面，包括工伤认定、伤残等级鉴定、地方规定以及双方协商等。职工在协商解除劳动合同时应谨慎对待，确保自己的合法权益得到妥善保障。如有需要，务必及时寻求专业法律帮助以维护自身权益。