刑法修正案在适用时确实遵循从旧兼从轻原则。这一原则是刑法适用中的一项重要原则，旨在平衡法的稳定性与公正性，确保公民权利得到保障，并体现刑法有利于被告人的精神。下面我将从多个角度详细解释这一原则在刑法修正案中的适用：

一、从旧兼从轻原则的含义

从旧兼从轻原则，简而言之，就是在刑法溯及力问题上，原则上应适用行为时的法律（即旧法），但如果新法对行为人更为有利（即不认为是犯罪或处刑较轻），则应适用新法。这一原则既体现了对法的安定性的尊重，又兼顾了对行为人权益的保护。

二、从旧兼从轻原则在刑法修正案中的具体适用

1. 原刑法不认为是犯罪，刑法修正案认为是犯罪的：

   • 在这种情况下，应遵循“从旧”原则，即适用原刑法规定，刑法修正案不具有溯及力。这是因为公民在行为时依据的是当时的法律，若事后因法律修改而被追究刑事责任，将违背法的稳定性和公民的合理预期。

2. 原刑法认为是犯罪，但刑法修正案不认为是犯罪的：

   • 对于此类行为，如果案件尚未经过审判或判决尚未生效，则应适用“从轻”原则，即按照刑法修正案的规定处理，此时刑法修正案具有溯及力。这体现了刑法对被告人权益的特别保护。

3. 原刑法和刑法修正案都认为是犯罪：

   • 在这种情况下，应比较两部法律对同一行为规定的处罚轻重，并选择适用处罚较轻的规定。这既符合“从轻”原则，也体现了刑法的公正性和人道主义精神。

三、特殊情况的法律规定

根据《中华人民共和国刑法》第十二条的规定，对于本法施行以前已经作出的生效判决，即使按照刑法修正案的规定该行为不构成犯罪或处刑较轻，也应继续维持原判决的有效性。这是为了维护司法判决的稳定性和权威性。

四、从旧兼从轻原则的意义

1. 保障公民权利：

   • 从旧兼从轻原则确保了公民在行为时能够依据当时的法律来预测自己的行为后果，从而避免了因法律变更而导致的不公平处罚。这体现了刑法对公民权利的尊重和保护。

2. 维护法律权威：

   • 通过遵循从旧兼从轻原则，法律能够保持其稳定性和可预测性，从而维护了法律的权威性和社会的稳定和谐。

3. 体现刑法精神：

   • 从旧兼从轻原则体现了刑法有利于被告人的精神，即在法律适用上优先选择对被告人更为有利的法律。这有助于实现刑法的公正性和人道主义目标。

五、实际应用中的注意事项

在司法实践中，法官应根据具体案件情况灵活运用从旧兼从轻原则。对于涉及刑法溯及力的问题，应仔细比较新旧法的规定，确保法律的正确适用。同时，应注重保护行为人的合法权益，确保刑罚的公正性和合理性。

总结来说，刑法修正案在适用时确实遵循从旧兼从轻原则。这一原则既体现了对法的安定性的尊重，又兼顾了对行为人权益的保护。在司法实践中，应严格遵循这一原则，确保法律的公正、合理和有效实施。如果你有任何关于刑法修正案或从旧兼从轻原则的具体问题，欢迎直接向我咨询。