学校将两个学期两次分发的绩效报税成全年一次性奖金，这一做法是否合法，需分情况讨论：

1. 若绩效工资实际发放形式与报税形式不符，且未经员工同意：

   • 法律分析：根据《中华人民共和国个人所得税法》及相关实施条例，工资、薪金所得应按月计征个人所得税。全年一次性奖金是指行政机关、企事业单位等扣缴义务人根据其全年经济效益和对雇员全年工作业绩的综合考核情况，向雇员发放的一次性奖金。若学校将两个学期分发的绩效工资，未经员工同意，擅自合并为全年一次性奖金进行报税，这实际上改变了工资的实际发放形式，可能违反了税法的相关规定，也损害了员工的合法权益。
   • 建议：员工有权要求学校按照实际发放情况调整报税方式，并补缴因错误报税而可能产生的税款差额。若学校拒绝调整，员工可以向当地税务机关举报，由税务机关进行调查处理。

2. 若绩效工资实际发放形式与报税形式相符，或经员工同意：

   • 法律分析：如果学校在发放绩效工资时，已经明确告知员工将按照全年一次性奖金的方式进行报税，并且员工对此表示同意，那么这种做法在法律上可能是被允许的。但前提是，这种报税方式必须符合税法的相关规定，且不得损害员工的合法权益。
   • 建议：尽管在这种情况下报税方式可能是合法的，但学校仍应确保报税的准确性和透明度，避免因此引发不必要的纠纷。同时，员工也应仔细了解报税方式及其可能产生的税务影响，以便做出明智的决策。

3. 税务合规性角度：

   • 法律分析：无论学校采用何种报税方式，都必须确保符合税法的相关规定。全年一次性奖金的计税方法有其特定的规定，包括计税公式、税率等。如果学校在报税过程中存在错误或违规行为，可能会面临税务机关的处罚。
   • 建议：学校应咨询专业的税务机构或律师，确保报税方式的合法性和合规性。同时，学校也应定期对报税情况进行自查，及时发现并纠正可能存在的问题。

额外提醒：

• 员工在遇到此类问题时，应首先与学校进行沟通，了解报税方式的具体情况和原因。
• 如果沟通无果或认为学校的做法存在违法行为，员工可以向当地税务机关或劳动监察部门举报。
• 在处理此类问题时，员工应保留好相关证据，如工资条、报税记录等，以便在需要时提供证明。

总结：学校将两个学期两次分发的绩效报税成全年一次性奖金是否合法，取决于多种因素，包括实际发放形式、员工同意情况以及税务合规性等。如果员工对此存在疑问或认为学校的做法存在问题，建议直接向我咨询，以便获得更具体的法律建议。