结论：即使您的车已修好开走，若保险公司拒赔合理，您可能需自行承担费用；若拒赔不合理，您仍有权通过法律途径追偿，且修理厂的权利义务需根据具体情况判断。以下是详细分析：

一、保险公司拒赔是否合理？

1. 合同条款审查
   需首先核查您与保险公司签订的保险合同中关于“追尾事故”“责任认定”“免赔情形”等条款。例如：

   • 若合同明确约定“被追尾且无责时，由对方保险公司赔付”，而您选择向己方保险公司索赔，可能被拒；
   • 若对方逃逸或无保险，您是否购买了“无法找到第三方特约险”？未购买则可能被拒赔；
   • 若事故存在酒驾、无证驾驶等免责情形，保险公司有权拒赔。

2. 责任认定依据
   保险公司拒赔需以交警出具的《事故责任认定书》为依据。若认定对方全责，您应优先向对方或其保险公司索赔；若您被认定有责（如急刹导致后车追尾），则需按责任比例承担损失。

二、车辆已修好，是否还需处理？

1. 修理厂的权利义务

   • 若您已支付修理费：修理厂无权再向您主张费用，但您需保留发票、维修清单等证据，以备向责任方追偿；
   • 若修理厂与对方保险公司直接结算：您无需再介入，但需确认维修项目与事故损伤一致；
   • 若修理厂未结清费用：可能面临被追讨的风险，需尽快协调责任方或保险公司支付。

2. 您的后续行动建议

   • 向责任方索赔：若对方全责，可要求其或其保险公司直接支付修理费；若对方拒赔，可凭《事故责任认定书》、维修发票等向法院起诉；
   • 申请保险代位追偿：若您无责且对方未赔偿，可向己方保险公司申请“代位追偿”（需符合合同约定），由保险公司先赔付您，再向对方追偿；
   • 投诉或诉讼：若保险公司无合理理由拒赔，可向当地银保监会投诉或直接起诉保险公司。

三、关键风险提示

1. 诉讼时效：向对方或保险公司索赔的诉讼时效为3年，自知道权利受损之日起计算，逾期可能丧失胜诉权；
2. 证据保留：务必保存《事故责任认定书》、维修发票、沟通记录等证据，避免因证据缺失导致维权困难；
3. 保险合同变更：若此次事故涉及免赔条款，未来续保时保险公司可能提高保费或拒保，需提前做好规划。

行动建议：

1. 立即联系对方驾驶员或其保险公司，确认赔偿进度；
   
2. 若对方拒赔，向己方保险公司申请代位追偿（需符合合同条件）；
   
3. 整理所有证据，必要时委托律师介入谈判或诉讼。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。