结论：农村在果园搭建棚子是否违法，需根据具体情况判断，主要涉及土地用途、规划许可、建设审批等多个方面。以下从不同角度详细分析：

1. 土地用途与性质

• 基本农田保护：若果园位于基本农田保护区内，根据《基本农田保护条例》等相关规定，禁止任何单位和个人在基本农田保护区内建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动。搭建棚子可能被视为改变土地用途，属于违法行为。
• 一般农用地：若果园位于一般农用地上，虽非基本农田，但搭建棚子仍需符合土地利用总体规划和农业用途。若棚子用于农业生产（如存放农具、农产品等），且未改变土地农业用途，可能不构成违法；但若用于非农业用途（如居住、商业经营等），则可能违法。

2. 规划许可与建设审批

• 乡村建设规划许可：根据《城乡规划法》，在乡、村庄规划区内进行乡村公共设施和公益事业建设以及农村村民住宅建设，不得占用农用地；确需占用农用地的，应当依照《土地管理法》有关规定办理农用地转用审批手续后，由城市、县人民政府城乡规划主管部门核发乡村建设规划许可证。搭建棚子若属于建设行为，需取得乡村建设规划许可证。
• 建设审批手续：除规划许可外，搭建棚子还可能涉及建设工程施工许可等审批手续。若未取得相关审批，擅自搭建，可能构成违法建设。

3. 具体情形分析

• 临时性棚子：若搭建的棚子为临时性、简易结构，且用于农业生产需要（如临时存放农具、遮阳避雨等），且未对土地造成永久性破坏，可能不构成违法。但需注意，即使临时性棚子，也需符合当地相关规定，避免影响他人权益或公共安全。
• 永久性棚子：若搭建的棚子为永久性结构，或用于非农业用途，则更可能构成违法。此时，不仅需取得规划许可和建设审批，还需符合土地用途管制要求。

4. 法律后果与建议

• 法律后果：若未经批准擅自搭建棚子，可能面临责令停止建设、限期改正、罚款、拆除等行政处罚；若造成土地破坏或影响他人权益，还可能承担民事赔偿责任；情节严重的，还可能构成犯罪。
• 建议：在搭建棚子前，建议先咨询当地自然资源部门或农业农村部门，了解土地用途、规划许可和建设审批等相关要求；确保搭建行为符合法律法规规定，避免违法风险。

总结：农村在果园搭建棚子是否违法，需根据土地用途、规划许可、建设审批等多个方面综合判断。为确保合法合规，建议在搭建前咨询相关部门并办理必要手续。如有任何疑问或需要进一步法律帮助，请直接向我咨询。