在市场管理公司破产案件中，若原告商铺财产被管理人托管，可按以下思路处理：

1. 核实托管合法性
   首先需审查管理人托管行为的法律依据。根据《企业破产法》第25条，管理人职责包括接管债务人财产，但需以法院指定为前提。若管理人未依法取得指定文件或超出法院授权范围托管财产，可能构成程序违法。建议立即向管理人索要法院指定书及托管授权文件，核对托管范围是否包含您的商铺财产。

2. 财产保全与异议程序
   若托管行为合法但侵害权益，可分两步维权：

• 申请财产保全：依据《企业破产法》第19条，向受理破产案件的法院申请对托管财产采取保全措施，防止管理人擅自处置。需提交财产权属证明（如商铺产权证、租赁合同）及托管行为损害权益的证据（如托管协议、财产清单）。
  
• 提出执行异议：若管理人已实际控制财产，可依据《民事诉讼法》第232条向执行法院提出书面异议，要求中止托管行为并返还财产。异议期为收到执行通知之日起10日内，逾期可能丧失救济权。

1. 参与破产程序主张权利
   作为债权人，您需在破产程序中积极主张权利：
   

• 申报债权：根据《企业破产法》第48条，在法院确定的债权申报期限内（通常为30日至3个月），向管理人提交债权申报材料，包括财产损失证明、托管协议等，主张财产返还或赔偿请求权。
  
• 参加债权人会议：依据第62条，通过债权人会议审查托管财产处置方案，对管理人提出的财产变价、分配方案行使表决权，防止财产被低价处置或优先清偿其他债权。

1. 追究管理人责任
   若管理人存在故意或重大过失导致财产损失，可依据《企业破产法》第130条追究其赔偿责任：
   

• 收集证据：证明管理人未尽勤勉义务（如未定期公示财产状况、擅自变卖财产），或存在与第三方串通损害债权人利益的行为。
  
• 提起诉讼：向受理破产案件的法院提起管理人责任纠纷之诉，要求管理人赔偿财产损失。诉讼时效为知道或应当知道权利受损之日起3年内。

行动建议：立即整理商铺财产权属证明、托管协议、财产清单等证据材料，向管理人书面要求说明托管依据及财产现状，同步向法院申请财产保全。若管理人拒绝配合或财产已被处置，需在10日内提出执行异议，并在债权申报期内完成债权申报，避免丧失救济机会。