结论：父亲被监委留置期间查扣儿子房产二年四个月，这一行为可能涉及多种法律情形，主要包括房产与父亲违法违纪行为存在关联、房产登记存在错误或瑕疵、以及法律程序上的特殊规定等。以下是对这些情形的详细分析：

1. 房产与父亲违法违纪行为存在关联：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国监察法》及相关规定，监察机关在调查涉嫌贪污贿赂、失职渎职等严重职务违法或者职务犯罪时，有权依法对涉案单位和个人的财产采取查封、扣押、冻结等措施。
   • 分析：如果儿子的房产实际上是由父亲出资购买，或者房产的收益被父亲用于违法违纪活动，那么该房产就可能与父亲的违法违纪行为存在关联。在这种情况下，监察机关有权对该房产进行查扣，以作为证据或用于后续的违法所得追缴。
   • 建议：如果儿子认为房产与自己无关，或者房产的取得是合法的，那么可以向监察机关提供相关证据，如购房合同、付款凭证等，以证明房产的合法性。

2. 房产登记存在错误或瑕疵：

   • 法律背景：房产登记是确认房产所有权的重要依据。如果房产登记存在错误或瑕疵，如登记在儿子名下但实际上属于父亲所有，那么监察机关在调查父亲时可能会对该房产进行查扣。
   • 分析：在这种情况下，儿子需要证明房产的实际所有权归属。如果儿子能够提供充分的证据证明房产属于自己所有，且与父亲的违法违纪行为无关，那么可以向监察机关提出异议，要求解除查扣。
   • 建议：儿子可以收集购房合同、付款凭证、房产证等证据，以证明房产的合法性和所有权归属。同时，也可以咨询专业律师，了解具体的法律程序和维权途径。

3. 法律程序上的特殊规定：

   • 法律背景：在某些特殊情况下，法律可能允许监察机关在调查过程中对与案件无关但可能影响案件调查的财产进行查扣。这种查扣通常是暂时的，且需要在法律规定的期限内解除。
   • 分析：如果儿子的房产被查扣是因为法律程序上的特殊规定，那么需要了解具体的法律规定和查扣期限。如果查扣期限已经超过法律规定的时间，或者查扣行为本身存在违法之处，那么儿子可以向监察机关提出异议，要求解除查扣或寻求法律救济。
   • 建议：儿子可以咨询专业律师，了解具体的法律规定和查扣期限。如果认为查扣行为违法或期限已过，可以向监察机关提出书面异议，并保留好相关证据以备后续维权之用。

额外提醒：在处理此类问题时，儿子应保持冷静和理性，积极配合监察机关的调查工作。同时，也要及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及具体的法律程序和维权途径。如果遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。